論文の概要: Gleason Score Prediction using Deep Learning in Tissue Microarray Image
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2005.04886v1
- Date: Mon, 11 May 2020 07:00:42 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-04 20:37:25.943433
- Title: Gleason Score Prediction using Deep Learning in Tissue Microarray Image
- Title(参考訳): 組織マイクロアレイ画像における深層学習を用いたグリーソンスコア予測
- Authors: Yi-hong Zhang, Jing Zhang, Yang Song, Chaomin Shen, Guang Yang
- Abstract要約: 我々はGleason 2019 Challengeデータセットを使用して、組織マイクロアレイ(TMA)画像を分割する畳み込みニューラルネットワーク(CNN)モデルを構築しました。
プレトレーニングした前立腺セグメンテーションモデルを用いて,Gleasonグレードセグメンテーションの精度を向上した。
このモデルはテストコホートで平均75.6%のDiceを達成し、Gleason 2019 Challengeで4位となり、コーエンのカッパとf1スコアを組み合わせたスコアは0.778となった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.959329921417618
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Prostate cancer (PCa) is one of the most common cancers in men around the
world. The most accurate method to evaluate lesion levels of PCa is microscopic
inspection of stained biopsy tissue and estimate the Gleason score of tissue
microarray (TMA) image by expert pathologists. However, it is time-consuming
for pathologists to identify the cellular and glandular patterns for Gleason
grading in large TMA images. We used Gleason2019 Challenge dataset to build a
convolutional neural network (CNN) model to segment TMA images to regions of
different Gleason grades and predict the Gleason score according to the grading
segmentation. We used a pre-trained model of prostate segmentation to increase
the accuracy of the Gleason grade segmentation. The model achieved a mean Dice
of 75.6% on the test cohort and ranked 4th in the Gleason2019 Challenge with a
score of 0.778 combined of Cohen's kappa and the f1-score.
- Abstract(参考訳): 前立腺癌(PCa)は、世界中の男性において最も多いがんの1つである。
PCaの病変レベルを評価する最も正確な方法は、染色された生検組織の顕微鏡検査と、専門の病理医による組織マイクロアレイ(TMA)画像のグリーソンスコアの推定である。
しかし、病理学者が大きなTMA画像でグリーソン分解の細胞および腺パターンを特定するのに時間がかかる。
我々は、Gleason2019 Challengeデータセットを使用して、畳み込みニューラルネットワーク(CNN)モデルを構築し、TMA画像を異なるGleasonグレードのリージョンに分割し、グレーディングセグメンテーションに従ってGleasonスコアを予測する。
プレトレーニングした前立腺セグメンテーションモデルを用いて,Gleasonグレードセグメンテーションの精度を高めた。
このモデルはテストコホートで平均75.6%のDiceを達成し、Gleason2019 Challengeで4位となり、コーエンのカッパとf1スコアを組み合わせたスコアは0.778となった。
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