論文の概要: Simultaneous imputation and disease classification in incomplete medical
datasets using Multigraph Geometric Matrix Completion (MGMC)
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2005.06935v1
- Date: Thu, 14 May 2020 13:11:35 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-03 04:30:34.026199
- Title: Simultaneous imputation and disease classification in incomplete medical
datasets using Multigraph Geometric Matrix Completion (MGMC)
- Title(参考訳): multigraph geometric matrix completion (mgmc) を用いた不完全医療データセットの同時インプテーションと疾患分類
- Authors: Gerome Vivar, Anees Kazi, Hendrik Burwinkel, Andreas Zwergal, Nassir
Navab, Seyed-Ahmad Ahmadi
- Abstract要約: 我々は,Multigraph Geometric Matrix Completionを用いて,不完全な医療データセットのインプットと疾患予測のエンドツーエンド学習を提案する。
我々は,最先端の手法と比較して,分類と計算性能の観点から,提案手法の優位性を実証的に示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 37.160335232396406
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Large-scale population-based studies in medicine are a key resource towards
better diagnosis, monitoring, and treatment of diseases. They also serve as
enablers of clinical decision support systems, in particular Computer Aided
Diagnosis (CADx) using machine learning (ML). Numerous ML approaches for CADx
have been proposed in literature. However, these approaches assume full data
availability, which is not always feasible in clinical data. To account for
missing data, incomplete data samples are either removed or imputed, which
could lead to data bias and may negatively affect classification performance.
As a solution, we propose an end-to-end learning of imputation and disease
prediction of incomplete medical datasets via Multigraph Geometric Matrix
Completion (MGMC). MGMC uses multiple recurrent graph convolutional networks,
where each graph represents an independent population model based on a key
clinical meta-feature like age, sex, or cognitive function. Graph signal
aggregation from local patient neighborhoods, combined with multigraph signal
fusion via self-attention, has a regularizing effect on both matrix
reconstruction and classification performance. Our proposed approach is able to
impute class relevant features as well as perform accurate classification on
two publicly available medical datasets. We empirically show the superiority of
our proposed approach in terms of classification and imputation performance
when compared with state-of-the-art approaches. MGMC enables disease prediction
in multimodal and incomplete medical datasets. These findings could serve as
baseline for future CADx approaches which utilize incomplete datasets.
- Abstract(参考訳): 医学における大規模人口ベース研究は、疾患の診断、モニタリング、治療のための重要な資源である。
また、臨床診断支援システム、特に機械学習(ML)を用いたコンピュータ支援診断(CADx)の実現にも役立っている。
CADxに対する多くのMLアプローチが文献で提案されている。
しかし、これらのアプローチは、臨床データでは必ずしも実現不可能な完全なデータ可用性を前提としている。
データの欠落を考慮すれば、不完全なデータサンプルは削除またはインデュートされ、データのバイアスを引き起こし、分類性能に悪影響を及ぼす可能性がある。
本研究では,マルチグラフ幾何行列補完(mgmc)による不完全医療データセットのインプテーションと疾患予測のエンドツーエンド学習を提案する。
MGMCは複数の反復グラフ畳み込みネットワークを使用し、各グラフは年齢、性別、認知機能といった重要な臨床メタ機能に基づいて、独立した人口モデルを表す。
局所患者近傍からのグラフ信号アグリゲーションとセルフアテンションによるマルチグラフ信号融合は、マトリックス再構成と分類性能の両方に正規化効果を持つ。
提案手法は, 関連する特徴を分類し, 2つの医用データセットの正確な分類を行うことができる。
提案手法は,最先端手法と比較して分類とインプテーション性能の点で優れていることを示す。
MGMCは、マルチモーダルおよび不完全な医療データセットにおける疾患予測を可能にする。
これらの発見は、不完全なデータセットを使用する将来のcadxアプローチのベースラインとなる可能性がある。
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