論文の概要: Towards Explainable Graph Representations in Digital Pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.00311v1
- Date: Wed, 1 Jul 2020 08:05:26 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-14 23:10:42.552206
- Title: Towards Explainable Graph Representations in Digital Pathology
- Title(参考訳): デジタル病理における説明可能なグラフ表現を目指して
- Authors: Guillaume Jaume, Pushpak Pati, Antonio Foncubierta-Rodriguez, Florinda
Feroce, Giosue Scognamiglio, Anna Maria Anniciello, Jean-Philippe Thiran,
Orcun Goksel, Maria Gabrani
- Abstract要約: グラフ内の診断上重要な要素を強調するコンパクトなインスタンスごとの説明を導出するためのポストホック説明器を提案する。
乳がんサブタイプにおける細胞および細胞間相互作用の解析に焦点をあてるが、提案する説明器は、デジタル病理学における他のトポロジ的表現にまで拡張できるほど汎用的である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 9.369422379741982
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Explainability of machine learning (ML) techniques in digital pathology (DP)
is of great significance to facilitate their wide adoption in clinics.
Recently, graph techniques encoding relevant biological entities have been
employed to represent and assess DP images. Such paradigm shift from pixel-wise
to entity-wise analysis provides more control over concept representation. In
this paper, we introduce a post-hoc explainer to derive compact per-instance
explanations emphasizing diagnostically important entities in the graph.
Although we focus our analyses to cells and cellular interactions in breast
cancer subtyping, the proposed explainer is generic enough to be extended to
other topological representations in DP. Qualitative and quantitative analyses
demonstrate the efficacy of the explainer in generating comprehensive and
compact explanations.
- Abstract(参考訳): デジタル病理学(DP)における機械学習(ML)技術の説明可能性は非常に重要である。
近年,DP画像の表現と評価のために,関連生物学的実体をコードするグラフ技術が採用されている。
このようなパラダイムをピクセル単位からエンティティ単位にシフトすることで、概念表現をよりコントロールできるようになります。
本稿では,グラフ内の診断的に重要な要素を強調するコンパクトなパーインテンス説明を導出するポストホック説明器を提案する。
乳がんサブタイプにおける細胞および細胞間相互作用の解析に焦点をあてるが,提案法はDPの他のトポロジカル表現に拡張できるほど汎用的である。
定性的かつ定量的な分析は、包括的でコンパクトな説明を生成するための説明器の有効性を示す。
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