論文の概要: Weakly supervised multiple instance learning histopathological tumor
segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2004.05024v4
- Date: Tue, 11 May 2021 12:26:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-14 20:44:45.321809
- Title: Weakly supervised multiple instance learning histopathological tumor
segmentation
- Title(参考訳): 弱教師付き複数症例学習による病理組織学的腫瘍分節
- Authors: Marvin Lerousseau, Maria Vakalopoulou, Marion Classe, Julien Adam,
Enzo Battistella, Alexandre Carr\'e, Th\'eo Estienne, Th\'eophraste Henry,
Eric Deutsch, Nikos Paragios
- Abstract要約: スライド画像全体のセグメント化のための弱教師付きフレームワークを提案する。
トレーニングモデルに複数のインスタンス学習スキームを利用する。
提案するフレームワークは,The Cancer Genome AtlasとPatchCamelyonデータセットのマルチロケーションとマルチ中心公開データに基づいて評価されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 51.085268272912415
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Histopathological image segmentation is a challenging and important topic in
medical imaging with tremendous potential impact in clinical practice. State of
the art methods rely on hand-crafted annotations which hinder clinical
translation since histology suffers from significant variations between cancer
phenotypes. In this paper, we propose a weakly supervised framework for whole
slide imaging segmentation that relies on standard clinical annotations,
available in most medical systems. In particular, we exploit a multiple
instance learning scheme for training models. The proposed framework has been
evaluated on multi-locations and multi-centric public data from The Cancer
Genome Atlas and the PatchCamelyon dataset. Promising results when compared
with experts' annotations demonstrate the potentials of the presented approach.
The complete framework, including $6481$ generated tumor maps and data
processing, is available at https://github.com/marvinler/tcga_segmentation.
- Abstract(参考訳): 病理組織像のセグメンテーションは医用画像において困難かつ重要な話題であり,臨床応用に多大な影響を与える可能性がある。
病理組織学は癌表現型間の有意な変異に苦しむため、臨床翻訳を妨げる手作りのアノテーションに依存している。
本稿では,ほとんどの医療システムで利用可能な標準臨床アノテーションに依拠した全スライド画像分割のための弱い教師付きフレームワークを提案する。
特に、トレーニングモデルに複数のインスタンス学習方式を利用する。
提案するフレームワークは,The Cancer Genome AtlasとPatchCamelyonデータセットのマルチロケーションとマルチ中心公開データに基づいて評価されている。
専門家のアノテーションと比較すると、提示されたアプローチの可能性を示す結果が得られる。
6481ドルの腫瘍マップとデータ処理を含む完全なフレームワークはhttps://github.com/marvinler/tcga_segmentation.comから入手できる。
関連論文リスト
- Visual Prompt Engineering for Medical Vision Language Models in Radiology [0.1636269503300992]
ビジョン言語モデル(VLP)は、ゼロショットパフォーマンスの分類を改善するために学習を活用することで、有望なソリューションを提供する。
本稿では,視覚的プロンプト工学の可能性を探究し,重要な領域への潜在的関心を高める。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-08-28T13:53:27Z) - Scribble-Based Interactive Segmentation of Medical Hyperspectral Images [4.675955891956077]
本研究は、医用ハイパースペクトル画像のためのスクリブルベースのインタラクティブセグメンテーションフレームワークを導入する。
提案手法は,特徴抽出のための深層学習と,ユーザが提供するスクリブルから生成された測地距離マップを利用する。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-08-05T12:33:07Z) - Anatomy-guided Pathology Segmentation [56.883822515800205]
本研究では, 解剖学的特徴と病理学的情報を組み合わせた汎用的セグメンテーションモデルを構築し, 病理学的特徴のセグメンテーション精度を高めることを目的とする。
我々の解剖学・病理学交流(APEx)訓練では,ヒト解剖学の問合せ表現に結合特徴空間をデコードする問合せベースのセグメンテーション変換器を用いている。
これにより、FDG-PET-CTとChest X-Rayの病理分類タスクにおいて、強力なベースライン法に比べて最大3.3%のマージンで、ボード全体で最高の結果を報告できる。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-07-08T11:44:15Z) - COIN: Counterfactual inpainting for weakly supervised semantic segmentation for medical images [3.5418498524791766]
本研究は, 新規なカウンターファクト・インパインティング・アプローチ(COIN)の開発である。
COINは、予測された分類ラベルを生成モデルを用いて異常から正常に反転させる。
本手法の有効性は,エストニアのタルツ大学病院から取得したCT画像から,合成標的と実際の腎腫瘍を分離することによって実証される。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-04-19T12:09:49Z) - Segmentation, Classification and Interpretation of Breast Cancer Medical Images using Human-in-the-Loop Machine Learning [37.69303106863453]
本論文は、乳癌のゲノムデータと全スライドイメージング(WSI)解析の統合を扱っている。
病理医の関与は, より優れたセグメンテーションモデルの開発と, モデルの説明能力の向上に役立ったが, 分類結果は準最適であった。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-03-29T10:49:02Z) - Multi-task Explainable Skin Lesion Classification [54.76511683427566]
少ないラベル付きデータでよく一般化する皮膚病変に対する数発のショットベースアプローチを提案する。
提案手法は,アテンションモジュールや分類ネットワークとして機能するセグメンテーションネットワークの融合を含む。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-10-11T05:49:47Z) - Towards Automated Semantic Segmentation in Mammography Images [0.0]
乳頭, 胸部筋, 線維腺組織, 脂肪組織を, 標準乳房造影画像で区分けするための深層学習ベースの枠組みを提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-07-18T15:04:42Z) - Rethinking Semi-Supervised Medical Image Segmentation: A
Variance-Reduction Perspective [51.70661197256033]
医用画像セグメンテーションのための階層化グループ理論を用いた半教師付きコントラスト学習フレームワークARCOを提案する。
まず、分散還元推定の概念を用いてARCOを構築することを提案し、特定の分散還元技術が画素/ボクセルレベルのセグメンテーションタスクにおいて特に有用であることを示す。
5つの2D/3D医療データセットと3つのセマンティックセグメンテーションデータセットのラベル設定が異なる8つのベンチマークで、我々のアプローチを実験的に検証する。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-02-03T13:50:25Z) - Few-shot Medical Image Segmentation using a Global Correlation Network
with Discriminative Embedding [60.89561661441736]
医療画像分割のための新しい手法を提案する。
深層畳み込みネットワークを用いた数ショット画像セグメンタを構築します。
深層埋め込みの識別性を高め,同一クラスの特徴領域のクラスタリングを促進する。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-12-10T04:01:07Z) - Explaining Clinical Decision Support Systems in Medical Imaging using
Cycle-Consistent Activation Maximization [112.2628296775395]
ディープニューラルネットワークを用いた臨床意思決定支援は、着実に関心が高まりつつあるトピックとなっている。
臨床医は、その根底にある意思決定プロセスが不透明で理解しにくいため、この技術の採用をためらうことが多い。
そこで我々は,より小さなデータセットであっても,分類器決定の高品質な可視化を生成するCycleGANアクティベーションに基づく,新たな意思決定手法を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-10-09T14:39:27Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。