論文の概要: MADGAN: unsupervised Medical Anomaly Detection GAN using multiple
adjacent brain MRI slice reconstruction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.13559v2
- Date: Mon, 12 Oct 2020 10:43:15 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-07 06:41:40.909525
- Title: MADGAN: unsupervised Medical Anomaly Detection GAN using multiple
adjacent brain MRI slice reconstruction
- Title(参考訳): MADGAN : 複数の隣接脳MRIスライス再構成を用いた無監督医用異常GAN
- Authors: Changhee Han, Leonardo Rundo, Kohei Murao, Tomoyuki Noguchi, Yuki
Shimahara, Zoltan Adam Milacski, Saori Koshino, Evis Sala, Hideki Nakayama,
Shinichi Satoh
- Abstract要約: 非教師付き医療異常検出ジェネレーターネットワーク(MADGAN)は、GANベースの複数の隣接脳MRIスライス再構成を用いた新しい2段階の手法である。
トレーニングには,1,133個の健常T1強調画像(T1)と135個の健常T1強調画像(T1c)からなる2種類のデータセットを用いて,アルツハイマー病(AD)と脳転移・静脈疾患を検出する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 24.423056428713718
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Unsupervised learning can discover various unseen abnormalities, relying on
large-scale unannotated medical images of healthy subjects. Towards this,
unsupervised methods reconstruct a 2D/3D single medical image to detect
outliers either in the learned feature space or from high reconstruction loss.
However, without considering continuity between multiple adjacent slices, they
cannot directly discriminate diseases composed of the accumulation of subtle
anatomical anomalies, such as Alzheimer's Disease (AD). Moreover, no study has
shown how unsupervised anomaly detection is associated with either disease
stages, various (i.e., more than two types of) diseases, or multi-sequence
Magnetic Resonance Imaging (MRI) scans. Therefore, we propose unsupervised
Medical Anomaly Detection Generative Adversarial Network (MADGAN), a novel
two-step method using GAN-based multiple adjacent brain MRI slice
reconstruction to detect brain anomalies at different stages on multi-sequence
structural MRI: (Reconstruction) Wasserstein loss with Gradient Penalty + 100
L1 loss-trained on 3 healthy brain axial MRI slices to reconstruct the next 3
ones-reconstructs unseen healthy/abnormal scans; (Diagnosis) Average L2 loss
per scan discriminates them, comparing the ground truth/reconstructed slices.
For training, we use two different datasets composed of 1,133 healthy
T1-weighted (T1) and 135 healthy contrast-enhanced T1 (T1c) brain MRI scans for
detecting AD and brain metastases/various diseases, respectively. Our
Self-Attention MADGAN can detect AD on T1 scans at a very early stage, Mild
Cognitive Impairment (MCI), with Area Under the Curve (AUC) 0.727, and AD at a
late stage with AUC 0.894, while detecting brain metastases on T1c scans with
AUC 0.921.
- Abstract(参考訳): 教師なし学習は、健康な被験者の大規模無注釈の医療画像に依存することで、目に見えない様々な異常を発見できる。
これに向けて、教師なしの方法で2D/3D画像の再構成を行い、学習した特徴空間内または高い再構成損失から外れ値を検出する。
しかし、隣り合うスライス間の連続性を考慮せずに、アルツハイマー病(AD)のような微妙な解剖学的異常の蓄積からなる疾患を直接識別することはできない。
さらに、教師なしの異常検出が病期、様々な病気(すなわち2種類以上の疾患)、あるいはマルチシーケンス磁気共鳴イメージング(MRI)スキャンにどのように関連しているかは研究されていない。
Therefore, we propose unsupervised Medical Anomaly Detection Generative Adversarial Network (MADGAN), a novel two-step method using GAN-based multiple adjacent brain MRI slice reconstruction to detect brain anomalies at different stages on multi-sequence structural MRI: (Reconstruction) Wasserstein loss with Gradient Penalty + 100 L1 loss-trained on 3 healthy brain axial MRI slices to reconstruct the next 3 ones-reconstructs unseen healthy/abnormal scans; (Diagnosis) Average L2 loss per scan discriminates them, comparing the ground truth/reconstructed slices.
トレーニングには、1,133個の健常T1強調画像(T1)と135個の健常T1強調画像(T1c)の2種類のデータセットを用いて,ADと脳転移/各種疾患の検出を行った。
我々の自己注意型MADGANは、非常に早い段階でT1スキャンのAD、軽度認知障害(MCI)、AUC 0.894でAUCのArea Under the Curve(AUC) 0.727、ADを検出でき、同時にAUC 0.921でT1cスキャンの脳転移を検出できる。
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