論文の概要: Comparative study of deep learning methods for the automatic
segmentation of lung, lesion and lesion type in CT scans of COVID-19 patients
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.15546v4
- Date: Mon, 10 Jan 2022 08:26:14 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-05 21:04:50.992593
- Title: Comparative study of deep learning methods for the automatic
segmentation of lung, lesion and lesion type in CT scans of COVID-19 patients
- Title(参考訳): COVID-19患者のCTにおける肺・病変・病変の自動分離のための深層学習法の比較検討
- Authors: Sofie Tilborghs, Ine Dirks, Lucas Fidon, Siri Willems, Tom Eelbode,
Jeroen Bertels, Bart Ilsen, Arne Brys, Adriana Dubbeldam, Nico Buls,
Panagiotis Gonidakis, Sebasti\'an Amador S\'anchez, Annemiek Snoeckx, Paul M.
Parizel, Johan de Mey, Dirk Vandermeulen, Tom Vercauteren, David Robben, Dirk
Smeets, Frederik Maes, Jef Vandemeulebroucke, Paul Suetens
- Abstract要約: 新型コロナウイルスの迅速かつ正確な定量化にディープラーニングを使うことを提案する研究が増えている。
主な課題は、新型コロナウイルス(COVID-19)感染者の胸部CT検査における肺と肺の病変の自動分離である。
オープンソースと社内開発の両方のアルゴリズムを含む,マルチセンタデータセットを用いた12のディープラーニングアルゴリズムを比較した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.890747388531539
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Recent research on COVID-19 suggests that CT imaging provides useful
information to assess disease progression and assist diagnosis, in addition to
help understanding the disease. There is an increasing number of studies that
propose to use deep learning to provide fast and accurate quantification of
COVID-19 using chest CT scans. The main tasks of interest are the automatic
segmentation of lung and lung lesions in chest CT scans of confirmed or
suspected COVID-19 patients. In this study, we compare twelve deep learning
algorithms using a multi-center dataset, including both open-source and
in-house developed algorithms. Results show that ensembling different methods
can boost the overall test set performance for lung segmentation, binary lesion
segmentation and multiclass lesion segmentation, resulting in mean Dice scores
of 0.982, 0.724 and 0.469, respectively. The resulting binary lesions were
segmented with a mean absolute volume error of 91.3 ml. In general, the task of
distinguishing different lesion types was more difficult, with a mean absolute
volume difference of 152 ml and mean Dice scores of 0.369 and 0.523 for
consolidation and ground glass opacity, respectively. All methods perform
binary lesion segmentation with an average volume error that is better than
visual assessment by human raters, suggesting these methods are mature enough
for a large-scale evaluation for use in clinical practice.
- Abstract(参考訳): 新型コロナウイルスに関する最近の研究は、ct画像が疾患の進行状況の評価と診断の支援に有用な情報を提供し、疾患の理解にも役立つことを示唆している。
深層学習を用いて、胸部CTスキャンを用いて新型コロナウイルスの迅速かつ正確な定量化を提供することを提案する研究が増えている。
主な課題は、新型コロナウイルス(COVID-19)感染者の胸部CT検査における肺と肺の病変の自動分離である。
本研究では,オープンソースと社内開発の両方のアルゴリズムを含む,マルチセンタデータセットを用いた12のディープラーニングアルゴリズムを比較した。
以上の結果から,肺分画,二分性病変分画,多群病変分画に対するテストセット全体の性能は,それぞれ0.982点,0.724点,0.469点であった。
結果として生じた2つの病変は、平均絶対体積誤差91.3mlで区切られた。
総じて, 病変の種類を識別する作業は, 152mlの平均絶対容積差と0.369点, 0.523点であった。
すべての方法は、平均ボリュームエラーを伴う2値性病変分画を行い、人手による視覚的評価よりも優れており、これらの方法が臨床での使用のための大規模評価に十分成熟していることを示唆している。
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