論文の概要: 3D Semantic Segmentation of Brain Tumor for Overall Survival Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2008.11576v2
- Date: Sun, 29 Nov 2020 04:59:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-25 03:34:00.360302
- Title: 3D Semantic Segmentation of Brain Tumor for Overall Survival Prediction
- Title(参考訳): 脳腫瘍の3次元セマンティクスによる全生存予測
- Authors: Rupal Agravat, Mehul S Raval
- Abstract要約: 本稿では,3層エンコーダデコーダを用いた3次元完全畳み込みニューラルネットワークを用いた層配置について述べる。
ネットワークの検証セットダイススコアは、それぞれ0.74、0.88、0.73であり、腫瘍、全腫瘍、腫瘍コアを増強する。
回帰器は、検証セット上で44.8%の精度を達成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.7982492640302676
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Glioma, the malignant brain tumor, requires immediate treatment to improve
the survival of patients. Gliomas heterogeneous nature makes the segmentation
difficult, especially for sub-regions like necrosis, enhancing tumor,
non-enhancing tumor, and Edema. Deep neural networks like full convolution
neural networks and ensemble of fully convolution neural networks are
successful for Glioma segmentation. The paper demonstrates the use of a 3D
fully convolution neural network with a three layer encoder decoder approach
for layer arrangement. The encoder blocks include the dense modules, and
decoder blocks include convolution modules. The input to the network is 3D
patches. The loss function combines dice loss and focal loss functions. The
validation set dice score of the network is 0.74, 0.88, and 0.73 for enhancing
tumor, whole tumor, and tumor core, respectively. The Random Forest Regressor
uses shape, volumetric, and age features extracted from ground truth for
overall survival prediction. The regressor achieves an accuracy of 44.8% on the
validation set.
- Abstract(参考訳): 悪性脳腫瘍であるグリオーマは、患者の生存を改善するために直ちに治療を必要とする。
グリオーマの異種性は、特に壊死、腫瘍の増強、非拡張性腫瘍、浮腫などのサブ領域において、セグメンテーションを困難にする。
完全畳み込みニューラルネットワークや完全畳み込みニューラルネットワークなどのディープニューラルネットワークは、グリオーマのセグメンテーションに成功している。
本稿では,3層エンコーダデコーダを用いた3次元完全畳み込みニューラルネットワークを用いた層配置について述べる。
エンコーダブロックは密集したモジュールを含み、デコーダブロックは畳み込みモジュールを含む。
ネットワークへの入力は3Dパッチである。
損失関数はサイコロ損失関数と焦点損失関数を組み合わせたものである。
ネットワークの検証セットダイススコアは、それぞれ0.74、0.88、0.73であり、腫瘍、全腫瘍、腫瘍コアを増強する。
ランダムフォレスト回帰器は、全体生存予測のために、地上の真実から抽出された形状、体積、年齢の特徴を使用する。
レグレッサーは検証セット上で44.8%の精度を達成する。
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