論文の概要: Brain Tumor Classification on MRI in Light of Molecular Markers
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2409.19583v1
- Date: Sun, 29 Sep 2024 07:04:26 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-11-05 22:18:46.632714
- Title: Brain Tumor Classification on MRI in Light of Molecular Markers
- Title(参考訳): 分子マーカーを用いたMRIの脳腫瘍分類
- Authors: Jun Liu, Geng Yuan, Weihao Zeng, Hao Tang, Wenbin Zhang, Xue Lin, XiaoLin Xu, Dong Huang, Yanzhi Wang,
- Abstract要約: 1p/19q遺伝子の同時欠失は、低グレードグリオーマの臨床成績と関連している。
本研究の目的は,MRIを用いた畳み込みニューラルネットワークを脳がん検出に活用することである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 61.77272414423481
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In research findings, co-deletion of the 1p/19q gene is associated with clinical outcomes in low-grade gliomas. The ability to predict 1p19q status is critical for treatment planning and patient follow-up. This study aims to utilize a specially MRI-based convolutional neural network for brain cancer detection. Although public networks such as RestNet and AlexNet can effectively diagnose brain cancers using transfer learning, the model includes quite a few weights that have nothing to do with medical images. As a result, the diagnostic results are unreliable by the transfer learning model. To deal with the problem of trustworthiness, we create the model from the ground up, rather than depending on a pre-trained model. To enable flexibility, we combined convolution stacking with a dropout and full connect operation, it improved performance by reducing overfitting. During model training, we also supplement the given dataset and inject Gaussian noise. We use three--fold cross-validation to train the best selection model. Comparing InceptionV3, VGG16, and MobileNetV2 fine-tuned with pre-trained models, our model produces better results. On an validation set of 125 codeletion vs. 31 not codeletion images, the proposed network achieves 96.37\% percent F1-score, 97.46\% percent precision, and 96.34\% percent recall when classifying 1p/19q codeletion and not codeletion images.
- Abstract(参考訳): 研究報告では,1p/19q遺伝子の同時欠失は低次グリオーマの臨床成績と関連している。
1p19qの状態を予測できる能力は、治療計画と患者の追跡に重要である。
本研究の目的は,MRIを用いた畳み込みニューラルネットワークを脳がん検出に活用することである。
RestNetやAlexNetのような公開ネットワークは、転写学習を用いて脳がんを効果的に診断できるが、このモデルには医療画像とは無関係な重みが含まれている。
その結果、伝達学習モデルでは診断結果は信頼できない。
信頼性の問題に対処するため、事前訓練されたモデルに依存するのではなく、ゼロからモデルを作成する。
柔軟性を実現するため, オーバーフィッティングを低減し, コンボリューションスタックとドロップアウトとフル接続操作を併用し, 性能を向上した。
モデルトレーニング中、与えられたデータセットを補完し、ガウスノイズを注入する。
最適な選択モデルをトレーニングするために、3倍のクロスバリデーションを使用します。
InceptionV3,VGG16,MobileNetV2を事前学習モデルで微調整した場合と比較して,より優れた結果が得られる。
125のコードレプション対31の検証セットでは、コードレプション画像ではなく、1p/19qのコードレプションを分類すると96.37のF1スコア、97.46の精度、96.34のリコールを達成する。
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