論文の概要: Multimodal brain tumor classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2009.01592v2
- Date: Tue, 6 Oct 2020 16:05:22 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-22 07:26:39.934068
- Title: Multimodal brain tumor classification
- Title(参考訳): マルチモーダル脳腫瘍の分類
- Authors: Marvin Lerousseau, Eric Deutsh, Nikos Paragios
- Abstract要約: 本研究では,全スライド画像と磁気共鳴画像を組み合わせて腫瘍を分類する深層学習手法について検討する。
特に、私たちのソリューションは、スライド画像の分類全体のための強力で汎用的でモジュラーなアーキテクチャで構成されています。
2020年の計算精度医学の課題に先んじて実験が実施されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.984601297028256
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Cancer is a complex disease that provides various types of information
depending on the scale of observation. While most tumor diagnostics are
performed by observing histopathological slides, radiology images should yield
additional knowledge towards the efficacy of cancer diagnostics. This work
investigates a deep learning method combining whole slide images and magnetic
resonance images to classify tumors. In particular, our solution comprises a
powerful, generic and modular architecture for whole slide image
classification. Experiments are prospectively conducted on the 2020
Computational Precision Medicine challenge, in a 3-classes unbalanced
classification task. We report cross-validation (resp. validation)
balanced-accuracy, kappa and f1 of 0.913, 0.897 and 0.951 (resp. 0.91, 0.90 and
0.94). For research purposes, including reproducibility and direct performance
comparisons, our finale submitted models are usable off-the-shelf in a Docker
image available at
https://hub.docker.com/repository/docker/marvinler/cpm_2020_marvinler.
- Abstract(参考訳): 癌は、観察の規模によって様々な種類の情報を提供する複雑な疾患である。
ほとんどの腫瘍診断は病理組織学的スライドを観察することによって行われるが、放射線画像はがん診断の有効性に関する追加の知識をもたらすべきである。
本研究は,全スライド画像と磁気共鳴画像を組み合わせて腫瘍を分類する深層学習法について検討する。
特に当社のソリューションは,スライドイメージ全体の分類のための強力で汎用的でモジュール型のアーキテクチャで構成されています。
2020年の計算精度医学チャレンジでは、3段階の非バランスな分類タスクで実験が予定されている。
比較評価 (検証) は, 0.913, 0.897, 0.951のkappaとf1(0. 0.91, 0.90, 0.94)である。
再現性や直接的なパフォーマンス比較を含む研究目的のために、最終提出されたモデルは、Dockerイメージで、https://hub.docker.com/repository/docker/marvinler/cpm_2020_marvinlerで使用することができる。
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