論文の概要: Fully automated analysis of muscle architecture from B-mode ultrasound
images with deep learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2009.04790v1
- Date: Thu, 10 Sep 2020 11:44:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-20 04:04:54.595650
- Title: Fully automated analysis of muscle architecture from B-mode ultrasound
images with deep learning
- Title(参考訳): 深層学習を用いたBモード超音波画像からの筋構造自動解析
- Authors: Neil J. Cronin, Taija Finni, Olivier Seynnes
- Abstract要約: 我々は深部神経回路を訓練し,ラベル付き筋骨格超音波画像を用いて筋線維とアポニューロオースを検出する。
手動解析と2つの既存の半自動解析手法を用いて得られた画像と比較した。
本手法は完全に自動化され,オープンソースであり,単一画像やビデオから筋長,陰茎角,筋厚を推定できる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: B-mode ultrasound is commonly used to image musculoskeletal tissues, but one
major bottleneck is data interpretation, and analyses of muscle thickness,
pennation angle and fascicle length are often still performed manually. In this
study we trained deep neural networks (based on U-net) to detect muscle
fascicles and aponeuroses using a set of labelled musculoskeletal ultrasound
images. We then compared neural network predictions on new, unseen images to
those obtained via manual analysis and two existing semi/automated analysis
approaches (SMA and Ultratrack). With a GPU, inference time for a single image
with the new approach was around 0.7s, compared to 4.6s with a CPU. Our method
detects the locations of the superficial and deep aponeuroses, as well as
multiple fascicle fragments per image. For single images, the method gave
similar results to those produced by a non-trainable automated method (SMA;
mean difference in fascicle length: 1.1 mm) or human manual analysis (mean
difference: 2.1 mm). Between-method differences in pennation angle were within
1$^\circ$, and mean differences in muscle thickness were less than 0.2 mm.
Similarly, for videos, there was strong overlap between the results produced
with Ultratrack and our method, with a mean ICC of 0.73, despite the fact that
the analysed trials included hundreds of frames. Our method is fully automated
and open source, and can estimate fascicle length, pennation angle and muscle
thickness from single images or videos, as well as from multiple superficial
muscles. We also provide all necessary code and training data for custom model
development.
- Abstract(参考訳): Bモード超音波は筋骨格組織を画像化するのに一般的に用いられるが、大きなボトルネックはデータの解釈であり、筋肉の厚み、陰茎角、筋膜長の分析は手動で行うことが多い。
本研究では,筋骨格超音波画像を用いた深部神経回路(U-netをベースとした)の訓練を行った。
次に,新たに取得した画像に対するニューラルネットワークの予測を,手作業による解析と,既存の2つの半自動解析手法(smaとultratrack)による予測と比較した。
gpuでは、新しいアプローチで1つの画像の推論時間は0.7sで、cpuでは4.6sだった。
本手法は表面および深部アポニューロスの位置を検知し,画像毎に複数のファシクル断片を抽出する。
単一画像の場合、この手法は訓練不能な自動化法(SMA、ファシクルの長さの平均差:1.1mm)や人手による分析(平均差:2.1mm)と類似した結果を得た。
方法間差は1$^\circ$以下であり,筋肉厚の平均差は0.2mm以下であった。
同様に、ビデオの場合、Ultratrackと我々の方法で生成された結果の間には強い重なりがあり、平均ICCは0.73であり、分析された試験には数百フレームが含まれていた。
本手法は完全に自動化され,オープンソースであり,単一画像やビデオ,および複数の表面筋から筋長,陰茎角,筋厚を推定できる。
カスタムモデル開発に必要なコードやトレーニングデータもすべて提供しています。
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