論文の概要: Unsupervised Domain Adaptation via CycleGAN for White Matter
Hyperintensity Segmentation in Multicenter MR Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2009.04985v1
- Date: Thu, 10 Sep 2020 16:48:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-20 03:20:10.204359
- Title: Unsupervised Domain Adaptation via CycleGAN for White Matter
Hyperintensity Segmentation in Multicenter MR Images
- Title(参考訳): 多施設mr画像におけるホワイトマターハイパーインテンシティセグメンテーションのためのサイクガンによる非教師なし領域適応
- Authors: Julian Alberto Palladino, Diego Fernandez Slezak and Enzo Ferrante
- Abstract要約: 磁気共鳴画像における白色物質の過強度の定量化は、脳卒中、認知症、死亡のリスクを予測する指標となる。
過去数年間、バイオメディカルなイメージセグメンテーションに適した畳み込みニューラルネットワーク(CNN)は、このタスクにおけるこれまでのすべての技術より優れている。
本研究では,脳病変を有するマルチセンターMR画像に対して,非教師なし領域適応を行うために,CycleGAN (CycleGAN) を用いた方法について検討する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.627822659948232
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automatic segmentation of white matter hyperintensities in magnetic resonance
images is of paramount clinical and research importance. Quantification of
these lesions serve as a predictor for risk of stroke, dementia and mortality.
During the last years, convolutional neural networks (CNN) specifically
tailored for biomedical image segmentation have outperformed all previous
techniques in this task. However, they are extremely data-dependent, and
maintain a good performance only when data distribution between training and
test datasets remains unchanged. When such distribution changes but we still
aim at performing the same task, we incur in a domain adaptation problem (e.g.
using a different MR machine or different acquisition parameters for training
and test data). In this work, we explore the use of cycle-consistent
adversarial networks (CycleGAN) to perform unsupervised domain adaptation on
multicenter MR images with brain lesions. We aim at learning a mapping function
to transform volumetric MR images between domains, which are characterized by
different medical centers and MR machines with varying brand, model and
configuration parameters. Our experiments show that CycleGAN allows us to
reduce the Jensen-Shannon divergence between MR domains, enabling automatic
segmentation with CNN models on domains where no labeled data was available.
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴画像における白色物質ハイパーインテンシティの自動セグメンテーションは, 臨床的, 研究的に重要である。
これらの病変の定量化は、脳卒中、認知症、死亡のリスクを予測する指標となる。
過去数年間、バイオメディカルなイメージセグメンテーションに適した畳み込みニューラルネットワーク(CNN)は、このタスクにおけるこれまでのすべての技術より優れている。
しかし、それらは極めてデータ依存であり、トレーニングとテストデータセット間のデータ分散が変わらない場合に限り、優れたパフォーマンスを維持する。
このような分散が変化しても、同じタスクの実行を目標とする場合、ドメイン適応問題(例えば、異なるMRマシンや異なる取得パラメータを使用してトレーニングやテストデータ)が発生する。
本研究では,脳病変を有するマルチセンターMR画像に対して,非教師なし領域適応を行うために,CycleGAN(CycleGAN)を用いた。
異なる医療センターと、ブランド、モデル、構成パラメータの異なるmrマシンによって特徴付けられる領域間での容積mr画像を変換するためのマッピング関数の学習を目標とする。
実験の結果,CycleGANはMR領域間のJensen-Shannon分散を低減し,ラベル付きデータがない領域でのCNNモデルによる自動セグメンテーションを可能にすることがわかった。
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