論文の概要: Applying a random projection algorithm to optimize machine learning
model for breast lesion classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2009.09937v1
- Date: Wed, 9 Sep 2020 21:27:27 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-20 09:12:35.827232
- Title: Applying a random projection algorithm to optimize machine learning
model for breast lesion classification
- Title(参考訳): ランダムプロジェクションアルゴリズムによる乳房病変分類のための機械学習モデルの最適化
- Authors: Morteza Heidari (1), Sivaramakrishnan Lakshmivarahan (2),
Seyedehnafiseh Mirniaharikandehei (1), Gopichandh Danala (1), Sai Kiran R.
Maryada (2), Hong Liu (1), Bin Zheng (1), ((1) School of Electrical and
Computer Engineering, University of Oklahoma, Norman, OK, USA, (2) School of
Computer Sciences, University of Oklahoma, Norman, OK, USA)
- Abstract要約: 悪性腫瘤を644例,良性病変を833例と確認した1,487例のマンモグラフィーを対象とする振り返りデータセットを構築した。
いくつかの特徴次元削減手法を組み込んだサポートベクターマシン(SVM)モデルを構築し,悪性病変の可能性を予測した。
SVMは、一視点マンモグラフィーに表される各セグメント化された質量領域の確率スコアを生成する。
2次元マンモグラムに表される同じ質量の2つのスコアを融合することにより、ケースベース確率スコアも評価する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.2970239953900422
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Machine learning is widely used in developing computer-aided diagnosis (CAD)
schemes of medical images. However, CAD usually computes large number of image
features from the targeted regions, which creates a challenge of how to
identify a small and optimal feature vector to build robust machine learning
models. In this study, we investigate feasibility of applying a random
projection algorithm to build an optimal feature vector from the initially
CAD-generated large feature pool and improve performance of machine learning
model. We assemble a retrospective dataset involving 1,487 cases of mammograms
in which 644 cases have confirmed malignant mass lesions and 843 have benign
lesions. A CAD scheme is first applied to segment mass regions and initially
compute 181 features. Then, support vector machine (SVM) models embedded with
several feature dimensionality reduction methods are built to predict
likelihood of lesions being malignant. All SVM models are trained and tested
using a leave-one-case-out cross-validation method. SVM generates a likelihood
score of each segmented mass region depicting on one-view mammogram. By fusion
of two scores of the same mass depicting on two-view mammograms, a case-based
likelihood score is also evaluated. Comparing with the principle component
analyses, nonnegative matrix factorization, and Chi-squared methods, SVM
embedded with the random projection algorithm yielded a significantly higher
case-based lesion classification performance with the area under ROC curve of
0.84+0.01 (p<0.02). The study demonstrates that the random project algorithm is
a promising method to generate optimal feature vectors to help improve
performance of machine learning models of medical images.
- Abstract(参考訳): 機械学習は医療画像のコンピュータ支援診断(CAD)手法の開発に広く用いられている。
しかし、cadは通常、ターゲット領域から多数の画像特徴を計算し、ロバストな機械学習モデルを構築するために、小さく最適な特徴ベクトルをどのように特定するかという課題を引き起こす。
本研究では,まずCAD生成した大規模特徴プールから最適特徴ベクトルを構築するためにランダムなプロジェクションアルゴリズムを適用し,機械学習モデルの性能向上を図る。
悪性腫瘤を644例,良性病変を833例と確認した1,487例のマンモグラフィーを主訴とした振り返りデータセットを作成した。
CADスキームはまずセグメントマス領域に適用され、最初に181の特徴を計算する。
次に,いくつかの特徴次元削減手法を組み込んだ支持ベクトルマシン(SVM)モデルを構築し,病変の悪性度を予測する。
すべてのSVMモデルは、ケースアウトのクロスバリデーションメソッドを使用してトレーニングされ、テストされます。
SVMは、一視点マンモグラフィーに表される各セグメント化された質量領域の確率スコアを生成する。
2次元マンモグラムに表される同じ質量の2つのスコアを融合することにより、ケースベース確率スコアも評価される。
主成分分析,非負行列因子分解,chi-squared法と比較して,ランダム投影アルゴリズムを組み込んだsvmは,0.84+0.01 (p<0.02) のroc曲線下において有意に高いケースベース病変分類性能を示した。
この研究は、ランダムプロジェクトアルゴリズムが最適な特徴ベクトルを生成するための有望な方法であり、医療画像の機械学習モデルの性能向上に役立つことを示した。
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