論文の概要: RDCNet: Instance segmentation with a minimalist recurrent residual
network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.00991v1
- Date: Fri, 2 Oct 2020 13:36:45 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-12 01:08:20.806428
- Title: RDCNet: Instance segmentation with a minimalist recurrent residual
network
- Title(参考訳): RDCNet:最小限のリカレント残差ネットワークによるインスタンスセグメンテーション
- Authors: Raphael Ortiz, Gustavo de Medeiros, Antoine H.F.M. Peters, Prisca
Liberali, Markus Rempfler
- Abstract要約: 我々は、リカレント拡張畳み込みネットワーク(RDCNet)と呼ばれる最小限のリカレントネットワークを提案する。
RDCNetは、その出力を反復的に洗練し、解釈可能な中間予測を生成する共有スタック拡張畳み込み(sSDC)層で構成されている。
我々は,H&Eスライドの核セグメンテーション,光シート蛍光顕微鏡による3次元異方性スタック,およびトップビュー画像の葉セグメンテーションの3つのタスクに対して,その汎用性を実証した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.14999444543328289
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Instance segmentation is a key step for quantitative microscopy. While
several machine learning based methods have been proposed for this problem,
most of them rely on computationally complex models that are trained on
surrogate tasks. Building on recent developments towards end-to-end trainable
instance segmentation, we propose a minimalist recurrent network called
recurrent dilated convolutional network (RDCNet), consisting of a shared
stacked dilated convolution (sSDC) layer that iteratively refines its output
and thereby generates interpretable intermediate predictions. It is
light-weight and has few critical hyperparameters, which can be related to
physical aspects such as object size or density.We perform a sensitivity
analysis of its main parameters and we demonstrate its versatility on 3 tasks
with different imaging modalities: nuclear segmentation of H&E slides, of 3D
anisotropic stacks from light-sheet fluorescence microscopy and leaf
segmentation of top-view images of plants. It achieves state-of-the-art on 2 of
the 3 datasets.
- Abstract(参考訳): インスタンスセグメンテーションは定量顕微鏡のキーステップである。
この問題に対して、機械学習に基づくいくつかの手法が提案されているが、そのほとんどは、サロゲートタスクで訓練された計算学的に複雑なモデルに依存している。
近年のエンド・ツー・エンド・エンドのトレーニング可能なインスタンスセグメンテーションに向けた開発が進められている。我々は、再帰的拡張畳み込みネットワーク(RDCNet)と呼ばれる最小限の繰り返しネットワークを提案し、その出力を反復的に改善し、解釈可能な中間予測を生成する共有スタック拡張畳み込み(SDC)層からなる。
主パラメータの感度解析を行い,H&Eスライドの核セグメンテーション,光シート蛍光顕微鏡からの3次元異方性スタックの核セグメンテーション,および植物のトップビューイメージの葉セグメンテーションの3つのタスクに対して,その汎用性を示す。
3つのデータセットのうち2つで最先端を実現する。
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