論文の概要: Spatially-Variant CNN-based Point Spread Function Estimation for Blind
Deconvolution and Depth Estimation in Optical Microscopy
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.04011v2
- Date: Tue, 13 Oct 2020 09:39:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-09 12:50:40.687026
- Title: Spatially-Variant CNN-based Point Spread Function Estimation for Blind
Deconvolution and Depth Estimation in Optical Microscopy
- Title(参考訳): 光学顕微鏡におけるブラインドデコンボリューションと深さ推定のための空間変化型cnnに基づく点拡散関数推定
- Authors: Adrian Shajkofci, Michael Liebling
- Abstract要約: 薄めながら平らでない物体の光顕微鏡画像の解像度を向上する手法を提案する。
畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を用いた空間変動点スプレッド関数(PSF)モデルのパラメータを推定する。
本手法は,理想条件下での2乗ピアソン相関係数0.99で画像自体からPSFパラメータを復元する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.09170287691728
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Optical microscopy is an essential tool in biology and medicine. Imaging
thin, yet non-flat objects in a single shot (without relying on more
sophisticated sectioning setups) remains challenging as the shallow depth of
field that comes with high-resolution microscopes leads to unsharp image
regions and makes depth localization and quantitative image interpretation
difficult.
Here, we present a method that improves the resolution of light microscopy
images of such objects by locally estimating image distortion while jointly
estimating object distance to the focal plane. Specifically, we estimate the
parameters of a spatially-variant Point-Spread function (PSF) model using a
Convolutional Neural Network (CNN), which does not require instrument- or
object-specific calibration. Our method recovers PSF parameters from the image
itself with up to a squared Pearson correlation coefficient of 0.99 in ideal
conditions, while remaining robust to object rotation, illumination variations,
or photon noise. When the recovered PSFs are used with a spatially-variant and
regularized Richardson-Lucy deconvolution algorithm, we observed up to 2.1 dB
better signal-to-noise ratio compared to other blind deconvolution techniques.
Following microscope-specific calibration, we further demonstrate that the
recovered PSF model parameters permit estimating surface depth with a precision
of 2 micrometers and over an extended range when using engineered PSFs. Our
method opens up multiple possibilities for enhancing images of non-flat objects
with minimal need for a priori knowledge about the optical setup.
- Abstract(参考訳): 光学顕微鏡は生物学や医学において必須の道具である。
高分解能顕微鏡によるフィールドの浅い深さは、画像領域を非シャープにし、深度の局在化と定量的な画像解釈を困難にするので、(より洗練された分断設定に頼ることなく)1ショットで撮影することは依然として困難である。
本稿では,焦点面への物体距離を共同で推定しながら,局所的な歪みを推定することにより,物体の光顕微鏡像の解像度を向上させる手法を提案する。
具体的には、楽器やオブジェクト固有の校正を必要としない畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を用いて、空間変動点スプレッド関数(PSF)モデルのパラメータを推定する。
本手法は,物体回転,照明変動,光子雑音に頑健でありながら,理想条件下では最大0.99の正方形ピアソン相関係数を持つ画像からPSFパラメータを復元する。
得られたPSFを空間不変かつ正規化されたRichardson-Lucy復調アルゴリズムで使用すると、他のブラインド復調法と比較して最大2.1dBの信号-雑音比が向上する。
顕微鏡特異的キャリブレーションにより,psfモデルパラメータの復元により,2マイクロメートル以上の精度で表面深度を推定できることを示した。
提案手法は,光学的設定に関する事前知識を最小限に抑えつつ,非平坦物体の画像の強調を行う複数の可能性を開く。
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