論文の概要: Fluctuation-based deconvolution in fluorescence microscopy using
plug-and-play denoisers
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2303.11212v1
- Date: Mon, 20 Mar 2023 15:43:52 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-03-21 14:52:00.158673
- Title: Fluctuation-based deconvolution in fluorescence microscopy using
plug-and-play denoisers
- Title(参考訳): プラグアンドプレイデノイザを用いた蛍光顕微鏡のゆらぎに基づくデコンボリューション
- Authors: Vasiliki Stergiopoulou, Subhadip Mukherjee, Luca Calatroni, Laure
Blanc-F\'eraud
- Abstract要約: 蛍光顕微鏡で得られた生きた試料の画像の空間分解能は、可視光の回折により物理的に制限される。
この制限を克服するために、いくつかのデコンボリューションと超解像技術が提案されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.236663830879273
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The spatial resolution of images of living samples obtained by fluorescence
microscopes is physically limited due to the diffraction of visible light,
which makes the study of entities of size less than the diffraction barrier
(around 200 nm in the x-y plane) very challenging. To overcome this limitation,
several deconvolution and super-resolution techniques have been proposed.
Within the framework of inverse problems, modern approaches in fluorescence
microscopy reconstruct a super-resolved image from a temporal stack of frames
by carefully designing suitable hand-crafted sparsity-promoting regularisers.
Numerically, such approaches are solved by proximal gradient-based iterative
schemes. Aiming at obtaining a reconstruction more adapted to sample geometries
(e.g. thin filaments), we adopt a plug-and-play denoising approach with
convergence guarantees and replace the proximity operator associated with the
explicit image regulariser with an image denoiser (i.e. a pre-trained network)
which, upon appropriate training, mimics the action of an implicit prior. To
account for the independence of the fluctuations between molecules, the model
relies on second-order statistics. The denoiser is then trained on covariance
images coming from data representing sequences of fluctuating fluorescent
molecules with filament structure. The method is evaluated on both simulated
and real fluorescence microscopy images, showing its ability to correctly
reconstruct filament structures with high values of peak signal-to-noise ratio
(PSNR).
- Abstract(参考訳): 蛍光顕微鏡により得られた生体試料の画像の空間分解能は可視光の回折によって物理的に制限されるため、回折障壁(x-y平面では約200nm)よりも大きさの実体の研究は極めて困難である。
この制限を克服するために、いくつかのデコンボリューションと超解像技術が提案されている。
逆問題の枠組みの中では、蛍光顕微鏡の現代的なアプローチは、手作りのスパーシティープロモーティングレギュラーを慎重に設計することで、フレームの時間的スタックから超解像を再構成する。
数値的には、そのようなアプローチは近位勾配に基づく反復スキームによって解決される。
サンプルのフィラメント(例えば薄いフィラメント)に適合する再構成の獲得を目指して,コンバージェンス保証を伴うプラグアンドプレイのデノイジングアプローチを採用し,明示的な画像正規化に関連する近接演算子を,適切なトレーニングを行うと暗黙の事前動作を模倣するイメージデノイザー(即ち事前学習されたネットワーク)に置き換える。
分子間のゆらぎの独立性を考慮するため、モデルは二階統計に依存する。
デノイザーは、変動する蛍光分子の配列とフィラメント構造を表すデータから得られる共分散画像に基づいて訓練される。
本手法はシミュレーションおよび実蛍光顕微鏡画像の両方で評価され、ピーク信号対雑音比(psnr)の高いフィラメント構造を正確に再構成する能力を示す。
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