論文の概要: Leveraging Spatial Information in Radiology Reports for Ischemic Stroke
Phenotyping
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.05096v1
- Date: Sat, 10 Oct 2020 21:35:42 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-08 23:12:27.705770
- Title: Leveraging Spatial Information in Radiology Reports for Ischemic Stroke
Phenotyping
- Title(参考訳): 脳卒中表現型診断のための放射線医学レポートにおける空間情報活用
- Authors: Surabhi Datta and Shekhar Khanpara and Roy F. Riascos and Kirk Roberts
- Abstract要約: 微細な虚血性脳梗塞の表現型を分類することは、重要な臨床情報を特定することに依存する。
放射線レポートは、そのような表現型情報を決定するためのコンテキストを持つ関連情報を提供する。
位置特異的な情報を持つ脳卒中表現型に焦点をあてる:脳領域の影響を受ける、ラテラル、脳卒中ステージ、およびラクナリティ。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.14265630074361
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Classifying fine-grained ischemic stroke phenotypes relies on identifying
important clinical information. Radiology reports provide relevant information
with context to determine such phenotype information. We focus on stroke
phenotypes with location-specific information: brain region affected,
laterality, stroke stage, and lacunarity. We use an existing fine-grained
spatial information extraction system--Rad-SpatialNet--to identify clinically
important information and apply simple domain rules on the extracted
information to classify phenotypes. The performance of our proposed approach is
promising (recall of 89.62% for classifying brain region and 74.11% for
classifying brain region, side, and stroke stage together). Our work
demonstrates that an information extraction system based on a fine-grained
schema can be utilized to determine complex phenotypes with the inclusion of
simple domain rules. These phenotypes have the potential to facilitate stroke
research focusing on post-stroke outcome and treatment planning based on the
stroke location.
- Abstract(参考訳): 細粒度の脳卒中表現型の分類は重要な臨床情報を特定することに依存している。
放射線医学報告は、そのような表現型情報を決定するための文脈情報を提供する。
位置特異的な情報を持つ脳卒中表現型に焦点をあてる:脳領域の影響を受ける、ラテラル、脳卒中ステージ、およびラクナリティ。
既存の細粒度空間情報抽出システムrad-spatialnetを用いて臨床的に重要な情報を同定し,抽出された情報に簡単なドメインルールを適用し,表現型を分類する。
提案手法の性能は有望である(脳領域の分類には89.62%、脳領域の分類には74.11%)。
本研究は,細粒度スキーマに基づく情報抽出システムを用いて,単純なドメインルールを含む複雑な表現型を決定できることを実証する。
これらの表現型は、ストローク後の結果と脳卒中の位置に基づく治療計画に焦点を当てた脳卒中研究を促進する可能性がある。
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