論文の概要: CQ-VAE: Coordinate Quantized VAE for Uncertainty Estimation with
Application to Disk Shape Analysis from Lumbar Spine MRI Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.08713v2
- Date: Tue, 20 Oct 2020 20:23:40 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-06 11:40:55.366907
- Title: CQ-VAE: Coordinate Quantized VAE for Uncertainty Estimation with
Application to Disk Shape Analysis from Lumbar Spine MRI Images
- Title(参考訳): CQ-VAE:不確実性推定のための座標量子VAEと腰椎MRI画像からのディスク形状解析への応用
- Authors: Linchen Qian, Jiasong Chen, Timur Urakov, Weiyong Gu, Liang Liang
- Abstract要約: 本稿では,あいまいさの表現を学習し,確率的出力を生成するための強力な生成モデルを提案する。
我々のモデルは、CQ-VAE (Coordinate Quantization Variational Autoencoder) と呼ばれ、内部の離散確率分布を持つ離散潜在空間を用いている。
マッチングアルゴリズムを用いて、モデル生成サンプルと「地下構造」サンプルの対応性を確立する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.5841288368322592
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Ambiguity is inevitable in medical images, which often results in different
image interpretations (e.g. object boundaries or segmentation maps) from
different human experts. Thus, a model that learns the ambiguity and outputs a
probability distribution of the target, would be valuable for medical
applications to assess the uncertainty of diagnosis. In this paper, we propose
a powerful generative model to learn a representation of ambiguity and to
generate probabilistic outputs. Our model, named Coordinate Quantization
Variational Autoencoder (CQ-VAE) employs a discrete latent space with an
internal discrete probability distribution by quantizing the coordinates of a
continuous latent space. As a result, the output distribution from CQ-VAE is
discrete. During training, Gumbel-Softmax sampling is used to enable
backpropagation through the discrete latent space. A matching algorithm is used
to establish the correspondence between model-generated samples and
"ground-truth" samples, which makes a trade-off between the ability to generate
new samples and the ability to represent training samples. Besides these
probabilistic components to generate possible outputs, our model has a
deterministic path to output the best estimation. We demonstrated our method on
a lumbar disk image dataset, and the results show that our CQ-VAE can learn
lumbar disk shape variation and uncertainty.
- Abstract(参考訳): 医学画像では曖昧さは避けられず、しばしば異なる人間の専門家から異なる画像解釈(例えば、オブジェクト境界やセグメンテーションマップ)をもたらす。
したがって、あいまいさを学習し、ターゲットの確率分布を出力するモデルは、診断の不確実性を評価するために医療応用に有用である。
本稿では,あいまいさの表現を学習し,確率的出力を生成するための強力な生成モデルを提案する。
我々のモデルは、CQ-VAE(Coordinate Quantization Variational Autoencoder)と呼ばれ、連続潜時空間の座標を量子化し、内部の離散確率分布を持つ離散潜時空間を用いる。
その結果、CQ−VAEからの出力分布が離散化される。
トレーニング中、Gumbel-Softmaxサンプリングは離散潜在空間をバックプロパゲーションするために使用される。
マッチングアルゴリズムは、モデル生成サンプルと"接地真実"サンプルの対応を確立するために使用され、新しいサンプルを生成する能力とトレーニングサンプルを表現する能力との間にトレードオフが生じる。
可能な出力を生成する確率的成分に加えて、我々のモデルは最良の推定を出力する決定論的経路を持つ。
本手法を腰椎椎間板画像データセット上で実演し,CQ-VAEが腰椎椎間板形状の変化と不確かさを学習できることを示す。
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