論文の概要: An Adversarial Domain Separation Framework for Septic Shock Early
Prediction Across EHR Systems
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.13952v1
- Date: Mon, 26 Oct 2020 23:41:33 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-02 17:46:17.041038
- Title: An Adversarial Domain Separation Framework for Septic Shock Early
Prediction Across EHR Systems
- Title(参考訳): EHRシステム全体での懐疑的衝撃早期予測のための対向領域分離フレームワーク
- Authors: Farzaneh Khoshnevisan and Min Chi
- Abstract要約: 本稿では,異なる医療システムから収集したEHRの2つのカテゴリの相違に対処する汎用ドメイン適応(DA)フレームワークを提案する。
本研究は,米国における異なる医療システムから得られた2つの現実的 EHR を用いて,極めて困難な症状である敗血症性ショックの早期診断のための枠組みを評価する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.058760708627898
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Modeling patient disease progression using Electronic Health Records (EHRs)
is critical to assist clinical decision making. While most of prior work has
mainly focused on developing effective disease progression models using EHRs
collected from an individual medical system, relatively little work has
investigated building robust yet generalizable diagnosis models across
different systems. In this work, we propose a general domain adaptation (DA)
framework that tackles two categories of discrepancies in EHRs collected from
different medical systems: one is caused by heterogeneous patient populations
(covariate shift) and the other is caused by variations in data collection
procedures (systematic bias). Prior research in DA has mainly focused on
addressing covariate shift but not systematic bias. In this work, we propose an
adversarial domain separation framework that addresses both categories of
discrepancies by maintaining one globally-shared invariant latent
representation across all systems} through an adversarial learning process,
while also allocating a domain-specific model for each system to extract local
latent representations that cannot and should not be unified across systems.
Moreover, our proposed framework is based on variational recurrent neural
network (VRNN) because of its ability to capture complex temporal dependencies
and handling missing values in time-series data. We evaluate our framework for
early diagnosis of an extremely challenging condition, septic shock, using two
real-world EHRs from distinct medical systems in the U.S. The results show that
by separating globally-shared from domain-specific representations, our
framework significantly improves septic shock early prediction performance in
both EHRs and outperforms the current state-of-the-art DA models.
- Abstract(参考訳): EHR(Electronic Health Records)を用いた患者の疾患進行のモデル化は臨床的意思決定を支援するために重要である。
先行研究の大部分は、個々の医療システムから収集したERHを用いた効果的な疾患進行モデルの開発に重点を置いているが、比較的少ない研究で、様々なシステムにまたがる堅牢で汎用的な診断モデルの構築が研究されている。
本研究では,異種患者集団(共変量シフト)とデータ収集手順(システムバイアス)のばらつきを原因として,異なる医療システムから収集したEHRの2つのカテゴリの相違に対処する汎用ドメイン適応(DA)フレームワークを提案する。
DAにおける以前の研究は、主に共変量シフトに対処するが、体系的なバイアスには対処しない。
本研究は,逆学習プロセスを通じてグローバルに共有される不変な潜在表現を1つ保持し,またシステム間で統一できない局所的潜在表現を抽出するために,各システムに対してドメイン固有モデルを割り当てることによって,両カテゴリの差異に対処する,逆ドメイン分離フレームワークを提案する。
さらに,複雑な時間的依存関係を捕捉し,時系列データに欠落した値を処理できることから,変動リカレントニューラルネットワーク(VRNN)をベースとしたフレームワークを提案する。
本研究は,米国における異なる医療システムから得られた2つの現実的 EHR を用いて,極めて困難な症状である敗血症性ショックの早期診断のための枠組みを評価する。
その結果, ドメイン固有表現からグローバルシェアドを分離することにより, 両EHRの懐疑的ショック早期予測性能を著しく向上し, 最先端DAモデルより優れていることがわかった。
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