論文の概要: AbdomenCT-1K: Is Abdominal Organ Segmentation A Solved Problem?
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.14808v2
- Date: Wed, 21 Jul 2021 03:36:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-02 05:30:22.387187
- Title: AbdomenCT-1K: Is Abdominal Organ Segmentation A Solved Problem?
- Title(参考訳): AbdomenCT-1K:腹部臓器切開は解決の問題か?
- Authors: Jun Ma, Yao Zhang, Song Gu, Cheng Zhu, Cheng Ge, Yichi Zhang, Xingle
An, Congcong Wang, Qiyuan Wang, Xin Liu, Shucheng Cao, Qi Zhang, Shangqing
Liu, Yunpeng Wang, Yuhui Li, Jian He, Xiaoping Yang
- Abstract要約: 今回,12の医療センターから1000 (1K) 以上のCT検査を行い, 腹部CT臓器分節データセットAbdomenCT-1Kについて検討した。
肝,腎,脾,膵の分画について大規模に検討し,SOTA法の未解決分画問題を明らかにする。
未解決の問題を推し進めるために, 完全教師付き, 半教師付き, 弱教師付き, 連続学習のための4つのオルガンセグメンテーションベンチマークを構築した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 30.338209680140913
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: With the unprecedented developments in deep learning, automatic segmentation
of main abdominal organs seems to be a solved problem as state-of-the-art
(SOTA) methods have achieved comparable results with inter-rater variability on
many benchmark datasets. However, most of the existing abdominal datasets only
contain single-center, single-phase, single-vendor, or single-disease cases,
and it is unclear whether the excellent performance can generalize on diverse
datasets. This paper presents a large and diverse abdominal CT organ
segmentation dataset, termed AbdomenCT-1K, with more than 1000 (1K) CT scans
from 12 medical centers, including multi-phase, multi-vendor, and multi-disease
cases. Furthermore, we conduct a large-scale study for liver, kidney, spleen,
and pancreas segmentation and reveal the unsolved segmentation problems of the
SOTA methods, such as the limited generalization ability on distinct medical
centers, phases, and unseen diseases. To advance the unsolved problems, we
further build four organ segmentation benchmarks for fully supervised,
semi-supervised, weakly supervised, and continual learning, which are currently
challenging and active research topics. Accordingly, we develop a simple and
effective method for each benchmark, which can be used as out-of-the-box
methods and strong baselines. We believe the AbdomenCT-1K dataset will promote
future in-depth research towards clinical applicable abdominal organ
segmentation methods. The datasets, codes, and trained models are publicly
available at https://github.com/JunMa11/AbdomenCT-1K.
- Abstract(参考訳): 深層学習における前例のない進歩により,多くのベンチマークデータセットにおいて,最先端のSOTA (State-of-the-art) 手法がレータ間変動に匹敵する結果を得たため,主腹部臓器の自動分割は解決された問題であると考えられる。
しかし,既存の腹部データセットの多くは単一中心,単相,単相,単相のケースのみを含んでおり,優れたパフォーマンスが多様なデータセットで一般化できるかどうかは不明である。
本稿では,多段階,多ベンダ,多疾患を含む12の医療センターから1000 (1K) 以上のCTスキャンを行い,AbdomenCT-1Kとよばれる腹部CT臓器分割データセットを提案する。
さらに, 肝臓, 腎臓, 脾臓, 膵臓のセグメンテーションを大規模に検討し, 異なる医療センター, フェーズ, 未確認疾患に対する限定的な一般化能力など, SOTA法の未解決セグメンテーション問題を明らかにする。
未解決問題を進めるため,我々は,現在挑戦的で活発な研究課題である,完全教師あり,半教師あり,弱い教師あり,継続的な学習のための4つの臓器分節ベンチマークを構築した。
そこで本研究では,各ベンチマークに対する簡易かつ効果的な手法を開発し,既定の手法と強力なベースラインとして使用できる。
abdomenct-1kデータセットは,臨床応用腹部臓器分画法に関する今後の詳細な研究を促進するものと思われる。
データセット、コード、トレーニングされたモデルはhttps://github.com/JunMa11/AbdomenCT-1Kで公開されている。
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