論文の概要: Combining Graph Neural Networks and Spatio-temporal Disease Models to
Predict COVID-19 Cases in Germany
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2101.00661v1
- Date: Sun, 3 Jan 2021 16:39:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-12 11:34:51.447966
- Title: Combining Graph Neural Networks and Spatio-temporal Disease Models to
Predict COVID-19 Cases in Germany
- Title(参考訳): グラフニューラルネットワークと時空間病モデルを組み合わせたドイツのcovid-19感染者予測
- Authors: Cornelius Fritz, Emilio Dorigatti, David R\"ugamer
- Abstract要約: いくつかの専門家は、新型コロナウイルスの拡散を説明するために人間の移動性を考慮する必要性を求めた。
ほとんどの統計モデルや疫学モデルでは、人間の移動性を符号化するデータを含む非構造化データソースを直接組み込むことはできない。
本稿では,両研究方向のトレードオフを提案し,統計回帰モデルと機械学習モデルの利点を組み合わせた新しい学習手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: During 2020, the infection rate of COVID-19 has been investigated by many
scholars from different research fields. In this context, reliable and
interpretable forecasts of disease incidents are a vital tool for policymakers
to manage healthcare resources. Several experts have called for the necessity
to account for human mobility to explain the spread of COVID-19. Existing
approaches are often applying standard models of the respective research field.
This habit, however, often comes along with certain restrictions. For instance,
most statistical or epidemiological models cannot directly incorporate
unstructured data sources, including relational data that may encode human
mobility. In contrast, machine learning approaches may yield better predictions
by exploiting these data structures, yet lack intuitive interpretability as
they are often categorized as black-box models. We propose a trade-off between
both research directions and present a multimodal learning approach that
combines the advantages of statistical regression and machine learning models
for predicting local COVID-19 cases in Germany. This novel approach enables the
use of a richer collection of data types, including mobility flows and
colocation probabilities, and yields the lowest MSE scores throughout our
observational period in our benchmark study. The results corroborate the
necessity of including mobility data and showcase the flexibility and
interpretability of our approach.
- Abstract(参考訳): 2020年には、さまざまな研究分野の研究者が新型コロナウイルスの感染率を調査している。
この文脈では、疾病インシデントの信頼性と解釈可能な予測は、政策立案者が医療資源を管理する上で不可欠なツールである。
新型コロナウイルスの感染拡大を説明するため、複数の専門家が人間の移動性を考慮する必要があると訴えている。
既存のアプローチは、しばしば各研究分野の標準モデルを適用している。
しかし、この習慣は特定の制限を伴うことが多い。
例えば、統計学モデルや疫学モデルでは、人間の移動性を符号化するリレーショナルデータを含む非構造化データソースを直接組み込むことはできない。
対照的に、機械学習のアプローチは、これらのデータ構造を利用することによってより良い予測をもたらすが、しばしばブラックボックスモデルに分類されるため、直感的な解釈性が欠如している。
本稿では,ドイツにおける局所的な新型コロナウイルス感染予測のための統計的回帰モデルと機械学習モデルの利点を組み合わせたマルチモーダル学習手法を提案する。
この新たなアプローチにより,モビリティフローやコロケーション確率など,よりリッチなデータ型コレクションの利用が可能となり,我々の観測期間において最も低いmseスコアが得られた。
その結果,モビリティデータを含める必要性と,アプローチの柔軟性と解釈性が示された。
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