論文の概要: Predicting Patient Outcomes with Graph Representation Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2101.03940v1
- Date: Mon, 11 Jan 2021 15:04:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-04 18:38:53.468145
- Title: Predicting Patient Outcomes with Graph Representation Learning
- Title(参考訳): グラフ表現学習による患者の予後予測
- Authors: Emma Rocheteau, Catherine Tong, Petar Veli\v{c}kovi\'c, Nicholas Lane,
Pietro Li\`o
- Abstract要約: 類似した患者をグラフでつなげることで,診断を時間的情報として活用する。
LSTM-GNは、eICUデータベース上の滞在予測タスクの長さでLSTMのみのベースラインを上回っていることを実証します。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.47248250311484113
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Recent work on predicting patient outcomes in the Intensive Care Unit (ICU)
has focused heavily on the physiological time series data, largely ignoring
sparse data such as diagnoses and medications. When they are included, they are
usually concatenated in the late stages of a model, which may struggle to learn
from rarer disease patterns. Instead, we propose a strategy to exploit
diagnoses as relational information by connecting similar patients in a graph.
To this end, we propose LSTM-GNN for patient outcome prediction tasks: a hybrid
model combining Long Short-Term Memory networks (LSTMs) for extracting temporal
features and Graph Neural Networks (GNNs) for extracting the patient
neighbourhood information. We demonstrate that LSTM-GNNs outperform the
LSTM-only baseline on length of stay prediction tasks on the eICU database.
More generally, our results indicate that exploiting information from
neighbouring patient cases using graph neural networks is a promising research
direction, yielding tangible returns in supervised learning performance on
Electronic Health Records.
- Abstract(参考訳): 集中治療室(ICU)における患者の予後予測に関する最近の研究は、診断や医薬品などのスパースデータを無視した生理的時系列データに重点を置いている。
それらを含むと、通常はモデルの後期に連結され、稀な疾患のパターンから学ぶのに苦労する。
代わりに,類似した患者をグラフでつなげることで,診断を関係情報として活用する戦略を提案する。
そこで本研究では,時間的特徴抽出のための長期短期記憶ネットワーク(lstms)と患者周辺情報抽出のためのグラフニューラルネットワーク(gnns)を組み合わせたハイブリッドモデルを提案する。
LSTM-GNNは,eICUデータベース上の滞在予測タスクの長さにおいて,LSTMのみのベースラインよりも優れていることを示す。
より一般的には, グラフニューラルネットワークを用いた周辺患者の情報活用が有望な研究方向であり, 電子健康記録における教師付き学習成績に有意なリターンをもたらすことが示唆された。
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