論文の概要: Feature reduction for machine learning on molecular features: The
GeneScore
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2101.05546v1
- Date: Thu, 14 Jan 2021 10:58:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-03-29 00:45:52.216421
- Title: Feature reduction for machine learning on molecular features: The
GeneScore
- Title(参考訳): 分子機能に基づく機械学習の機能削減:遺伝子コア
- Authors: Alexander Denker, Anastasia Steshina, Theresa Grooss, Frank Ueckert,
Sylvia N\"urnberg
- Abstract要約: GeneScoreは、バイオメディカルデータの機械学習分析のための機能削減の概念です。
GeneScoreは癌実体の分類において二項行列よりも優れていることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 58.720142291102135
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: We present the GeneScore, a concept of feature reduction for Machine Learning
analysis of biomedical data. Using expert knowledge, the GeneScore integrates
different molecular data types into a single score. We show that the GeneScore
is superior to a binary matrix in the classification of cancer entities from
SNV, Indel, CNV, gene fusion and gene expression data. The GeneScore is a
straightforward way to facilitate state-of-the-art analysis, while making use
of the available scientific knowledge on the nature of molecular data features
used.
- Abstract(参考訳): バイオメディカルデータの機械学習解析における特徴量削減の概念であるGeneScoreを提案する。
専門家の知識を使って、GeneScoreは異なる分子データ型を単一のスコアに統合する。
SNV, Indel, CNV, 遺伝子融合および遺伝子発現データからがん物質を分類する際, GeneScore はバイナリマトリックスよりも優れていることを示す。
GeneScoreは、使用した分子データの特徴に関する科学知識を活用しながら、最先端の分析を容易にする簡単な方法である。
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