論文の概要: A hierarchical Bayesian model to find brain-behaviour associations in
incomplete data sets
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2103.06845v1
- Date: Thu, 11 Mar 2021 18:14:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-03-12 14:55:41.688084
- Title: A hierarchical Bayesian model to find brain-behaviour associations in
incomplete data sets
- Title(参考訳): 不完全データセットにおける脳行動関連の階層的ベイズモデル
- Authors: Fabio S. Ferreira, Agoston Mihalik, Rick A. Adams, John Ashburner,
Janaina Mourao-Miranda
- Abstract要約: グループファクター分析(GFA)は、ベイジアン推論とモダリティ特有の関連をモデル化する階層モデルである。
ヒトコネクトームプロジェクト(HCP)からの脳の接続性および非画像対策からなる合成および実データにGFAを適用しました。
GFAは、基礎となる共有および特定の要因を明らかにし、完全な不完全なデータセットで観測されていないデータモダリティを正しく予測した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Canonical Correlation Analysis (CCA) and its regularised versions have been
widely used in the neuroimaging community to uncover multivariate associations
between two data modalities (e.g., brain imaging and behaviour). However, these
methods have inherent limitations: (1) statistical inferences about the
associations are often not robust; (2) the associations within each data
modality are not modelled; (3) missing values need to be imputed or removed.
Group Factor Analysis (GFA) is a hierarchical model that addresses the first
two limitations by providing Bayesian inference and modelling modality-specific
associations. Here, we propose an extension of GFA that handles missing data,
and highlight that GFA can be used as a predictive model. We applied GFA to
synthetic and real data consisting of brain connectivity and non-imaging
measures from the Human Connectome Project (HCP). In synthetic data, GFA
uncovered the underlying shared and specific factors and predicted correctly
the non-observed data modalities in complete and incomplete data sets. In the
HCP data, we identified four relevant shared factors, capturing associations
between mood, alcohol and drug use, cognition, demographics and
psychopathological measures and the default mode, frontoparietal control,
dorsal and ventral networks and insula, as well as two factors describing
associations within brain connectivity. In addition, GFA predicted a set of
non-imaging measures from brain connectivity. These findings were consistent in
complete and incomplete data sets, and replicated previous findings in the
literature. GFA is a promising tool that can be used to uncover associations
between and within multiple data modalities in benchmark datasets (such as,
HCP), and easily extended to more complex models to solve more challenging
tasks.
- Abstract(参考訳): カノニカル相関分析(CCA)とその正規化バージョンは、脳画像と行動の2つのデータモダリティ間の多変量関連を明らかにするために、神経画像のコミュニティで広く利用されている。
しかし、これらの方法には固有の制限がある:(1)関連付けに関する統計的推論はしばしば堅牢ではない;(2)各データモダリティ内の関連はモデル化されない;(3)欠落した値はインプットされるか削除される必要がある。
グループ因子分析(gfa)は、ベイズ推論とモダリティ固有関係のモデリングを提供することで、最初の2つの制限に対処する階層モデルである。
本稿では、欠落データを扱うGFAの拡張を提案し、GFAが予測モデルとして使用できることを強調する。
我々は,ヒトコネクトームプロジェクト(hcp)による脳結合と非画像計測からなる合成データと実データにgfaを適用した。
合成データでは、GFAは基礎となる共有および特定の要因を明らかにし、完全かつ不完全なデータセットにおける観測されていないデータモダリティを正しく予測した。
hcpデータでは, 気分, アルコール, 薬物使用, 認知, 人口動態, 精神病理学的指標, デフォルトモード, 前頭頂側制御, 背側, 腹側ネットワーク, insulaの4つの関連因子と, 脳との結合関係を記述した2つの因子を同定した。
さらに、GFAは脳のコネクティビティから非画像対策のセットを予測した。
これらの結果は完全なデータセットと不完全なデータセットで一致し、文献で以前の知見を再現した。
GFAは有望なツールであり、ベンチマークデータセット(HCPなど)における複数のデータモダリティ間の関連を解明し、より困難なタスクを解決するためにより複雑なモデルに容易に拡張することができる。
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