論文の概要: Severity Quantification and Lesion Localization of COVID-19 on CXR using
Vision Transformer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2103.07062v1
- Date: Fri, 12 Mar 2021 03:17:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-03-15 13:28:22.352927
- Title: Severity Quantification and Lesion Localization of COVID-19 on CXR using
Vision Transformer
- Title(参考訳): ビジョントランスを用いたCXRにおけるCOVID-19の重症度定量と病変局在
- Authors: Gwanghyun Kim, Sangjoon Park, Yujin Oh, Joon Beom Seo, Sang Min Lee,
Jin Hwan Kim, Sungjun Moon, Jae-Kwang Lim, Jong Chul Ye
- Abstract要約: 世界的な新型コロナウイルス(covid-19)のパンデミックの中で、covid-19の重症度を定量化する自動化フレームワークの構築がますます重要になっている。
重症度と臨床応用可能な新型コロナウイルス関連病変の局在を定量化するための新しい視覚トランスフォーマを提案する。
我々のモデルは、弱い配列に基づくラベルから全確率マップを生成するために、弱教師付きで訓練されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 25.144248675578286
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Under the global pandemic of COVID-19, building an automated framework that
quantifies the severity of COVID-19 and localizes the relevant lesion on chest
X-ray images has become increasingly important. Although pixel-level lesion
severity labels, e.g. lesion segmentation, can be the most excellent target to
build a robust model, collecting enough data with such labels is difficult due
to time and labor-intensive annotation tasks. Instead, array-based severity
labeling that assigns integer scores on six subdivisions of lungs can be an
alternative choice enabling the quick labeling. Several groups proposed deep
learning algorithms that quantify the severity of COVID-19 using the
array-based COVID-19 labels and localize the lesions with explainability maps.
To further improve the accuracy and interpretability, here we propose a novel
Vision Transformer tailored for both quantification of the severity and
clinically applicable localization of the COVID-19 related lesions. Our model
is trained in a weakly-supervised manner to generate the full probability maps
from weak array-based labels. Furthermore, a novel progressive self-training
method enables us to build a model with a small labeled dataset. The
quantitative and qualitative analysis on the external testset demonstrates that
our method shows comparable performance with radiologists for both tasks with
stability in a real-world application.
- Abstract(参考訳): 新型コロナウイルスの世界的なパンデミック下では、covid-19の重症度を定量化し、胸部x線画像上の関連病変をローカライズする自動化フレームワークの構築がますます重要になっている。
ピクセルレベルの病変の重度ラベルは、例えば。
病変分割は、堅牢なモデルを構築するための最も優れたターゲットであり、そのようなラベルで十分なデータを収集することは、時間と労働集約的なアノテーションタスクのために困難です。
代わりに、6つの肺の分割に整数スコアを割り当てる配列ベースの重篤なラベル付けは、高速なラベル付けを可能にする代替選択肢となる。
いくつかのグループは、配列ベースのCOVID-19ラベルを使用してCOVID-19の重症度を定量化し、説明可能なマップで病変をローカライズするディープラーニングアルゴリズムを提案した。
さらに精度と解釈性を向上させるために、重症度の定量化と新型コロナウイルス関連病変の臨床的に適用可能な局在化の両方に適した新しいVision Transformerを提案します。
我々のモデルは、弱い配列に基づくラベルから全確率マップを生成するために、弱教師付きで訓練されている。
さらに、新しいプログレッシブな自己学習手法により、小さなラベル付きデータセットでモデルを構築することができる。
外部テストセットの定量的・定性的分析により,実世界のアプリケーションにおいて,両課題とも放射線科医と同等の性能を示すことが示された。
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