論文の概要: Vision Transformer using Low-level Chest X-ray Feature Corpus for
COVID-19 Diagnosis and Severity Quantification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2104.07235v1
- Date: Thu, 15 Apr 2021 04:54:48 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-16 15:08:50.308098
- Title: Vision Transformer using Low-level Chest X-ray Feature Corpus for
COVID-19 Diagnosis and Severity Quantification
- Title(参考訳): 新型コロナウイルス診断と重症度定量のための低レベル胸部X線画像変換器
- Authors: Sangjoon Park, Gwanghyun Kim, Yujin Oh, Joon Beom Seo, Sang Min Lee,
Jin Hwan Kim, Sungjun Moon, Jae-Kwang Lim, Jong Chul Ye
- Abstract要約: バックボーンネットワークから得られた低レベルCXR特徴コーパスを利用した新しいビジョントランスフォーマーを提案する。
バックボーンネットワークはまず、一般的な異常発見を検出するために、大きなパブリックデータセットでトレーニングされる。
次に、バックボーンネットワークからの埋め込み機能は、COVID-19の診断および重症度定量のためのトランスフォーマーモデルのコーポラとして使用されます。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 25.144248675578286
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Developing a robust algorithm to diagnose and quantify the severity of
COVID-19 using Chest X-ray (CXR) requires a large number of well-curated
COVID-19 datasets, which is difficult to collect under the global COVID-19
pandemic. On the other hand, CXR data with other findings are abundant. This
situation is ideally suited for the Vision Transformer (ViT) architecture,
where a lot of unlabeled data can be used through structural modeling by the
self-attention mechanism. However, the use of existing ViT is not optimal,
since feature embedding through direct patch flattening or ResNet backbone in
the standard ViT is not intended for CXR. To address this problem, here we
propose a novel Vision Transformer that utilizes low-level CXR feature corpus
obtained from a backbone network that extracts common CXR findings.
Specifically, the backbone network is first trained with large public datasets
to detect common abnormal findings such as consolidation, opacity, edema, etc.
Then, the embedded features from the backbone network are used as corpora for a
Transformer model for the diagnosis and the severity quantification of
COVID-19. We evaluate our model on various external test datasets from totally
different institutions to evaluate the generalization capability. The
experimental results confirm that our model can achieve the state-of-the-art
performance in both diagnosis and severity quantification tasks with superior
generalization capability, which are sine qua non of widespread deployment.
- Abstract(参考訳): Chest X-ray(CXR)を使用して、新型コロナウイルスの重症度を診断し定量化する堅牢なアルゴリズムを開発するには、新型コロナウイルスのパンデミック下での収集が困難である、多くの精度の高いCOVID-19データセットが必要である。
一方で、cxrデータと他の発見は豊富である。
この状況は視覚変換器(ViT)アーキテクチャに理想的であり、自己認識機構による構造モデリングを通じて多くのラベルのないデータを使用できる。
しかし、標準vitの直接パッチフラット化やresnetバックボーンによる機能埋め込みはcxrを意図していないため、既存のvitの使用は最適ではない。
本稿では,この問題を解決するために,共通するcxr所見を抽出するバックボーンネットワークから得られた低レベルcxr特徴コーパスを用いた視覚トランスフォーマを提案する。
具体的には、バックボーンネットワークはまず大きなパブリックデータセットでトレーニングされ、統合、不透明、浮腫などの一般的な異常所見を検出する。
次に、新型コロナウイルスの診断と重症度定量化のためのトランスフォーマーモデルのコーパスとして、バックボーンネットワークからの埋め込み特徴を用いる。
汎用性を評価するために, 全く異なる機関の各種外部テストデータセット上でのモデル評価を行った。
実験結果から,本モデルは広く展開されていない正弦波の一般化能力に優れ,診断および重症度定量化タスクにおいて最先端の性能を実現できることを確認した。
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