論文の概要: GasHis-Transformer: A Multi-scale Visual Transformer Approach for
Gastric Histopathology Image Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2104.14528v1
- Date: Thu, 29 Apr 2021 17:46:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-30 15:10:18.579252
- Title: GasHis-Transformer: A Multi-scale Visual Transformer Approach for
Gastric Histopathology Image Classification
- Title(参考訳): GasHis-Transformer:胃病理像分類のためのマルチスケール視覚変換器アプローチ
- Authors: Haoyuan Chen, Chen Li, Xiaoyan Li, Ge Wang, Weiming Hu, Yixin Li,
Wanli Liu, Changhao Sun, Yudong Yao, Marcin Grzegorzek
- Abstract要約: 本稿では,胃病理組織像分類(GHIC)タスクのためのマルチスケールビジュアルトランスフォーマモデル(GasHis-Transformer)を提案する。
GasHis-Transformer モデルは,グローバル情報モジュール (GIM) とローカル情報モジュール (LIM) の2つの基本モジュール上に構築されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 31.002557349690886
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: For deep learning methods applied to the diagnosis of gastric cancer
intelligently, existing methods concentrate more on Convolutional Neural
Networks (CNN) but no approaches are available using Visual Transformer (VT).
VT's efficient and stable deep learning models with the most recent application
in the field of computer vision, which is capable of improving the recognition
of global information in images. In this paper, a multi-scale visual
transformer model (GasHis-Transformer) is proposed for a gastric histopathology
image classification (GHIC) task, which enables the automatic classification of
gastric histological images of abnormal and normal cancer by obtained by
optical microscopy to facilitate the medical work of histopathologists. This
GasHis-Transformer model is built on two fundamental modules, including a
global information module (GIM) and a local information module (LIM). In the
experiment, an open source hematoxylin and eosin (H&E) stained gastric
histopathology dataset with 280 abnormal or normal images are divided into
training, validation, and test sets at a ratio of 1:1:2 first. Then,
GasHis-Transformer obtains precision, recall, F1-score, and accuracy on the
testing set of 98.0%, 100.0%, 96.0%, and 98.0%. Furthermore, a contrast
experiment also tests the generalization ability of the proposed
GatHis-Transformer model with a lymphoma image dataset including 374 images and
a breast cancer dataset including 1390 images in two extended experiments and
achieves an accuracy of 83.9% and 89.4%, respectively. Finally,
GasHis-Transformer model demonstrates high classification performance and shows
its effectiveness and enormous potential in GHIC tasks.
- Abstract(参考訳): 胃癌の診断にインテリジェントに応用する深層学習法では,既存の手法は畳み込みニューラルネットワーク(cnn)に重点を置いているが,視覚トランスフォーマ(vt)を用いたアプローチはない。
VTの効率的で安定したディープラーニングモデルは、コンピュータビジョンの分野における最新の応用であり、画像におけるグローバル情報の認識を改善することができる。
本稿では, 胃病理組織像分類(ghic)課題に対して, 光学顕微鏡により胃組織像と正常癌の胃組織像を自動的に分類し, 病理医の医療作業を容易にするマルチスケール視覚トランスフォーマモデル(gashis-transformer)を提案する。
このGasHis-Transformerモデルは,グローバル情報モジュール(GIM)とローカル情報モジュール(LIM)の2つの基本モジュール上に構築されている。
実験では、280個の異常または正常な画像を有するオープンソースのヘマトキシリンおよびエオシン(H&E)染色胃病理データセットを1:1:2の割合でトレーニング、バリデーション、テストセットに分割した。
そして、試験セット98.0%,100.0%,96.0%,98.0%の精度、リコール、f1スコア、精度を得る。
さらにコントラスト実験では、374の画像を含むリンパ腫画像データセットと2つの拡張実験で1390画像を含む乳がんデータセットを用いてgathis-transformerモデルの一般化能力を試験し、それぞれ83.9%と89.4%の精度を達成した。
最後に、GasHis-Transformerモデルは高い分類性能を示し、GHICタスクの有効性と膨大なポテンシャルを示す。
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