論文の概要: Bayesian structure learning and sampling of Bayesian networks with the R
package BiDAG
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.00488v1
- Date: Sun, 2 May 2021 14:42:32 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-05 01:58:18.445170
- Title: Bayesian structure learning and sampling of Bayesian networks with the R
package BiDAG
- Title(参考訳): RパッケージBiDAGによるベイズネットワークのベイズ構造学習とサンプリング
- Authors: Polina Suter and Jack Kuipers and Giusi Moffa and Niko Beerenwinkel
- Abstract要約: BiDAGはマルコフ連鎖モンテカルロ法(MCMC)を実装し、ベイジアンネットワークの構造学習とサンプリングを行う。
このパッケージには、最大 a posteriori (map) グラフを検索し、データが与えられた後続分布からグラフをサンプリングするツールが含まれている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The R package BiDAG implements Markov chain Monte Carlo (MCMC) methods for
structure learning and sampling of Bayesian networks. The package includes
tools to search for a maximum a posteriori (MAP) graph and to sample graphs
from the posterior distribution given the data. A new hybrid approach to
structure learning enables inference in large graphs. In the first step, we
define a reduced search space by means of the PC algorithm or based on prior
knowledge. In the second step, an iterative order MCMC scheme proceeds to
optimize within the restricted search space and estimate the MAP graph.
Sampling from the posterior distribution is implemented using either order or
partition MCMC. The models and algorithms can handle both discrete and
continuous data. The BiDAG package also provides an implementation of MCMC
schemes for structure learning and sampling of dynamic Bayesian networks.
- Abstract(参考訳): RパッケージBiDAGはマルコフ連鎖モンテカルロ法(MCMC)を実装し、ベイズネットワークの構造学習とサンプリングを行う。
このパッケージには、最大 a posteriori (map) グラフを検索し、データが与えられた後続分布からグラフをサンプリングするツールが含まれている。
構造学習への新しいハイブリッドアプローチは、大きなグラフで推論を可能にする。
最初のステップでは,PCアルゴリズムを用いて,あるいは事前知識に基づいて,検索スペースの削減を定義する。
2番目のステップでは、反復順序MCMCスキームが制限された探索空間内で最適化し、MAPグラフを推定する。
後部分布からのサンプリングは順序または分割MCMCを用いて行う。
モデルとアルゴリズムは離散データと連続データの両方を扱うことができる。
BiDAGパッケージはまた、動的ベイズネットワークの構造学習とサンプリングのためのMCMCスキームの実装も提供する。
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