論文の概要: Brain Multigraph Prediction using Topology-Aware Adversarial Graph
Neural Network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.02565v1
- Date: Thu, 6 May 2021 10:20:45 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-07 13:20:27.056344
- Title: Brain Multigraph Prediction using Topology-Aware Adversarial Graph
Neural Network
- Title(参考訳): トポロジ対応逆グラフニューラルネットワークを用いた脳波の予測
- Authors: Alaa Bessadok and Mohamed Ali Mahjoub and Islem Rekik
- Abstract要約: topoGANアーキテクチャを導入し、単一の脳グラフから複数の脳グラフを共同で予測する。
i) 1つのグラフから複数の脳グラフを予測する新しいグラフ対向オートエンコーダを設計すること、(ii)GANのモード崩壊問題に対処するために符号化されたソースグラフをクラスタリングすること、(iii)トポロジ的損失を導入して、トポロジ的ターゲット脳グラフの予測を強要することである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.6114012813668934
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Brain graphs (i.e, connectomes) constructed from medical scans such as
magnetic resonance imaging (MRI) have become increasingly important tools to
characterize the abnormal changes in the human brain. Due to the high
acquisition cost and processing time of multimodal MRI, existing deep learning
frameworks based on Generative Adversarial Network (GAN) focused on predicting
the missing multimodal medical images from a few existing modalities. While
brain graphs help better understand how a particular disorder can change the
connectional facets of the brain, synthesizing a target brain multigraph (i.e,
multiple brain graphs) from a single source brain graph is strikingly lacking.
Additionally, existing graph generation works mainly learn one model for each
target domain which limits their scalability in jointly predicting multiple
target domains. Besides, while they consider the global topological scale of a
graph (i.e., graph connectivity structure), they overlook the local topology at
the node scale (e.g., how central a node is in the graph). To address these
limitations, we introduce topology-aware graph GAN architecture (topoGAN),
which jointly predicts multiple brain graphs from a single brain graph while
preserving the topological structure of each target graph. Its three key
innovations are: (i) designing a novel graph adversarial auto-encoder for
predicting multiple brain graphs from a single one, (ii) clustering the encoded
source graphs in order to handle the mode collapse issue of GAN and proposing a
cluster-specific decoder, (iii) introducing a topological loss to force the
prediction of topologically sound target brain graphs. The experimental results
using five target domains demonstrated the outperformance of our method in
brain multigraph prediction from a single graph in comparison with baseline
approaches.
- Abstract(参考訳): 磁気共鳴画像(MRI)のような医療スキャンから構築された脳のグラフ(コネクトーム)は、人間の脳の異常な変化を特徴づける重要なツールになりつつある。
マルチモーダルMRIの取得コストと処理時間が高いため、GAN(Generative Adversarial Network)に基づく既存のディープラーニングフレームワークは、既存のいくつかのモダリティから欠落したマルチモーダル医療画像を予測することに重点を置いている。
脳のグラフは、特定の障害が脳の接続面をどのように変えるかを理解するのに役立つが、ターゲットの脳のマルチグラフ(つまり、複数の脳のグラフ)を単一のソースの脳のグラフから合成することは、著しく不足している。
さらに、既存のグラフ生成は、ターゲットドメインごとに1つのモデルを学び、複数のターゲットドメインを共同で予測するスケーラビリティを制限する。
さらに、グラフのグローバルトポロジースケール(グラフ接続構造)を考える一方で、ノードスケールの局所トポロジー(例えば、ノードがグラフにどれだけ中央にあるか)を見落とします。
これらの制約に対処するために,各対象グラフのトポロジ構造を維持しつつ,単一の脳グラフから複数の脳グラフを共同で予測するtopogan(topological-aware graph gan architecture)を導入する。
i) 単一のグラフから複数の脳グラフを予測する新しいグラフ対向オートエンコーダを設計し、(ii) GANのモード崩壊問題に対処するために符号化されたソースグラフをクラスタ化し、クラスタ固有のデコーダを提案し、(iii) トポロジ的損失を導入して、トポロジ的ターゲット脳グラフの予測を強制する。
5つの対象領域を用いた実験結果から,脳のマルチグラフ予測における本手法の有効性を,ベースラインアプローチと比較して実証した。
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