論文の概要: Contrastive Brain Network Learning via Hierarchical Signed Graph Pooling
Model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2207.07650v1
- Date: Thu, 14 Jul 2022 20:03:52 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-07-20 07:28:00.568573
- Title: Contrastive Brain Network Learning via Hierarchical Signed Graph Pooling
Model
- Title(参考訳): 階層型グラフポーリングモデルによるコントラスト脳ネットワーク学習
- Authors: Haoteng Tang, Guixiang Ma, Lei Guo, Xiyao Fu, Heng Huang, Liang Zhang
- Abstract要約: 脳機能ネットワーク上のグラフ表現学習技術は、臨床表現型および神経変性疾患のための新しいバイオマーカーの発見を容易にする。
本稿では,脳機能ネットワークからグラフレベル表現を抽出する階層型グラフ表現学習モデルを提案する。
また、モデルの性能をさらに向上させるために、機能的脳ネットワークデータをコントラスト学習のために拡張する新たな戦略を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 64.29487107585665
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Recently brain networks have been widely adopted to study brain dynamics,
brain development and brain diseases. Graph representation learning techniques
on brain functional networks can facilitate the discovery of novel biomarkers
for clinical phenotypes and neurodegenerative diseases. However, current graph
learning techniques have several issues on brain network mining. Firstly, most
current graph learning models are designed for unsigned graph, which hinders
the analysis of many signed network data (e.g., brain functional networks).
Meanwhile, the insufficiency of brain network data limits the model performance
on clinical phenotypes predictions. Moreover, few of current graph learning
model is interpretable, which may not be capable to provide biological insights
for model outcomes. Here, we propose an interpretable hierarchical signed graph
representation learning model to extract graph-level representations from brain
functional networks, which can be used for different prediction tasks. In order
to further improve the model performance, we also propose a new strategy to
augment functional brain network data for contrastive learning. We evaluate
this framework on different classification and regression tasks using the data
from HCP and OASIS. Our results from extensive experiments demonstrate the
superiority of the proposed model compared to several state-of-the-art
techniques. Additionally, we use graph saliency maps, derived from these
prediction tasks, to demonstrate detection and interpretation of phenotypic
biomarkers.
- Abstract(参考訳): 近年、脳ネットワークは脳のダイナミクス、脳の発達、脳疾患の研究に広く採用されている。
脳機能ネットワーク上のグラフ表現学習技術は、臨床表現型と神経変性疾患の新しいバイオマーカーの発見を促進する。
しかし、現在のグラフ学習技術は、脳ネットワークのマイニングにいくつかの問題がある。
まず、現在のグラフ学習モデルは符号なしグラフのために設計されており、多くの符号付きネットワークデータ(例えば脳機能ネットワーク)の分析を妨げる。
一方、脳ネットワークデータの不十分さは、臨床表現型予測のモデル性能を制限する。
さらに、現在のグラフ学習モデルのほとんどが解釈可能であり、モデルの結果に対する生物学的洞察を提供することができない可能性がある。
本稿では,様々な予測タスクに使用できる脳機能ネットワークからグラフレベル表現を抽出するための,解釈可能な階層的グラフ表現学習モデルを提案する。
さらに,モデルの性能をさらに向上させるため,機能的脳ネットワークデータによるコントラスト学習を増強する新しい戦略を提案する。
hcp と oasis のデータを用いて, 異なる分類および回帰タスクに関するこのフレームワークを評価した。
実験結果から,提案手法がいくつかの最先端技術よりも優れていることを示す。
さらに,これらの予測タスクから得られたグラフ塩分マップを用いて,表現型バイオマーカーの検出と解釈を行う。
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