論文の概要: Development of a Multi-Task Learning V-Net for Pulmonary Lobar
Segmentation on Computed Tomography and Application to Diseased Lungs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.05204v1
- Date: Tue, 11 May 2021 17:10:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-12 13:48:15.062263
- Title: Development of a Multi-Task Learning V-Net for Pulmonary Lobar
Segmentation on Computed Tomography and Application to Diseased Lungs
- Title(参考訳): ctによる肺小葉分割のためのマルチタスク学習v-netの開発と疾患肺への応用
- Authors: Marc Boubnovski Martell, Mitchell Chen, Kristofer Linton-Reid, Joram
M. Posma, Susan J Copley, Eric O. Aboagye
- Abstract要約: 疾患のある肺領域は、しばしばCT画像に高密度ゾーンを生成し、損傷した葉を特定するアルゴリズムの実行を制限する。
この影響は、肺葉を分節する機械学習手法の改善を動機づけた。
このアプローチは、放射線科医のロバストなツールとして臨床現場で容易に採用することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.19573380763700707
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automated lobar segmentation allows regional evaluation of lung disease and
is important for diagnosis and therapy planning. Advanced statistical workflows
permitting such evaluation is a needed area within respiratory medicine; their
adoption remains slow, with poor workflow accuracy. Diseased lung regions often
produce high-density zones on CT images, limiting an algorithm's execution to
specify damaged lobes due to oblique or lacking fissures. This impact motivated
developing an improved machine learning method to segment lung lobes that
utilises tracheobronchial tree information to enhance segmentation accuracy
through the algorithm's spatial familiarity to define lobar extent more
accurately. The method undertakes parallel segmentation of lobes and auxiliary
tissues simultaneously by employing multi-task learning (MTL) in conjunction
with V-Net-attention, a popular convolutional neural network in the imaging
realm. In keeping with the model's adeptness for better generalisation, high
performance was retained in an external dataset of patients with four distinct
diseases: severe lung cancer, COVID-19 pneumonitis, collapsed lungs and Chronic
Obstructive Pulmonary Disease (COPD), even though the training data included
none of these cases. The benefit of our external validation test is
specifically relevant since our choice includes those patients who have
diagnosed lung disease with associated radiological abnormalities. To ensure
equal rank is given to all segmentations in the main task we report the
following performance (Dice score) on a per-segment basis: normal lungs 0.97,
COPD 0.94, lung cancer 0.94, COVID-19 pneumonitis 0.94 and collapsed lung 0.92,
all at p<0.05. Even segmenting lobes with large deformations on CT images, the
model maintained high accuracy. The approach can be readily adopted in the
clinical setting as a robust tool for radiologists.
- Abstract(参考訳): 肺疾患の局所的評価を可能とし,診断と治療計画に重要である。
このような評価を可能にする高度な統計ワークフローは、呼吸医学において必要となる領域である。
疾患のある肺領域は、しばしばCT画像に高密度ゾーンを生成し、斜めや亀裂の欠如による損傷した葉を特定するアルゴリズムの実行を制限する。
この影響は、気胸木情報を利用した肺葉のセグメント化のための改良された機械学習手法を開発し、アルゴリズムの空間的親しみによるセグメント化精度を高め、葉の幅をより正確に定義する動機となった。
画像領域で一般的な畳み込みニューラルネットワークであるv-net-attentionと連携して、マルチタスク学習(mtl)を用いて、ローブと補助組織の並列セグメンテーションを同時に行う。
このモデルのより優れた一般化のための適性を維持しつつ、訓練データには含まれなかったが、重篤な肺癌、covid-19肺炎、倒れた肺、慢性閉塞性肺疾患(copd)の4つの異なる疾患の外部データセットに高いパフォーマンスが保持された。
放射線学的異常を伴う肺疾患と診断された患者を対象とする外的妥当性検査のメリットは,特に有意である。
メインタスクの全てのセグメンテーションに等しくランクを与えるためには、正常肺0.09、copd 0.94、肺がん0.04、covid-19 pneumonitis 0.94、崩壊肺0.22、すべてp<0.05である。
CT画像に大きな変形があるセグメンテーションローブでさえ、モデルは高い精度を維持した。
このアプローチは、放射線科医のロバストなツールとして臨床現場で容易に採用することができる。
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