論文の概要: A hybrid machine learning/deep learning COVID-19 severity predictive
model from CT images and clinical data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.06141v1
- Date: Thu, 13 May 2021 08:39:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-14 14:01:54.246346
- Title: A hybrid machine learning/deep learning COVID-19 severity predictive
model from CT images and clinical data
- Title(参考訳): CT画像と臨床データを用いたハイブリッド機械学習/深層学習型COVID-19重症度予測モデル
- Authors: Matteo Chieregato, Fabio Frangiamore, Mauro Morassi, Claudia Baresi,
Stefania Nici, Chiara Bassetti, Claudio Bn\`a and Marco Galelli
- Abstract要約: 患者を非icuとicuの2つのカテゴリーに分類するハイブリッド機械学習/深層学習モデルを開発した。
ベースラインCT画像の3次元患者レベルのCNN分類器を特徴抽出器として用いる。
本モデルは,臨床診断を医師に提供し,結果クラスに属する確率スコアと特徴のケースベースSHAPによる解釈を提供することを目的としている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: COVID-19 clinical presentation and prognosis are highly variable, ranging
from asymptomatic and paucisymptomatic cases to acute respiratory distress
syndrome and multi-organ involvement. We developed a hybrid machine
learning/deep learning model to classify patients in two outcome categories,
non-ICU and ICU (intensive care admission or death), using 558 patients
admitted in a northern Italy hospital in February/May of 2020. A fully 3D
patient-level CNN classifier on baseline CT images is used as feature
extractor. Features extracted, alongside with laboratory and clinical data, are
fed for selection in a Boruta algorithm with SHAP game theoretical values. A
classifier is built on the reduced feature space using CatBoost gradient
boosting algorithm and reaching a probabilistic AUC of 0.949 on holdout test
set. The model aims to provide clinical decision support to medical doctors,
with the probability score of belonging to an outcome class and with case-based
SHAP interpretation of features importance.
- Abstract(参考訳): 新型コロナウイルス(covid-19)の臨床症状と予後は、無症候性および側頭症から急性呼吸窮迫症候群、多臓器関与まで、非常に多様である。
我々は,2020年2月~5月にイタリア北部の病院で入院した558人の患者を用いて,非ICUとICUの2つの結果カテゴリーに分類するハイブリッド機械学習/深層学習モデルを開発した。
ベースラインCT画像上のフル3次元患者レベルCNN分類器を特徴抽出器として用いる。
実験データや臨床データとともに抽出された特徴は、shapゲーム理論値を持つborutaアルゴリズムで選択するために供給される。
CatBoostグラデーションブースティングアルゴリズムを用いて、縮小された特徴空間上に分類器を構築し、ホールドアウトテストセットで0.949の確率 AUC に達する。
本モデルは,臨床診断を医師に提供し,結果クラスに属する確率スコアと特徴のケースベースSHAPによる解釈を提供することを目的としている。
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