論文の概要: Multimodal Deep Learning for Personalized Renal Cell Carcinoma
Prognosis: Integrating CT Imaging and Clinical Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.03575v1
- Date: Fri, 7 Jul 2023 13:09:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-07-10 12:29:30.231684
- Title: Multimodal Deep Learning for Personalized Renal Cell Carcinoma
Prognosis: Integrating CT Imaging and Clinical Data
- Title(参考訳): 腎細胞癌予後診断のためのマルチモーダルディープラーニング : CT画像と臨床データの統合
- Authors: Maryamalsadat Mahootiha, Hemin Ali Qadir, Jacob Bergsland and Ilangko
Balasingham
- Abstract要約: 腎細胞癌は生存率の低い重要な世界的な健康上の課題である。
本研究の目的は, 腎細胞癌患者の生存確率を予測できる包括的深層学習モデルを考案することであった。
提案フレームワークは,3次元画像特徴抽出器,臨床変数選択,生存予測の3つのモジュールから構成される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.790959613880792
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Renal cell carcinoma represents a significant global health challenge with a
low survival rate. This research aimed to devise a comprehensive deep-learning
model capable of predicting survival probabilities in patients with renal cell
carcinoma by integrating CT imaging and clinical data and addressing the
limitations observed in prior studies. The aim is to facilitate the
identification of patients requiring urgent treatment. The proposed framework
comprises three modules: a 3D image feature extractor, clinical variable
selection, and survival prediction. The feature extractor module, based on the
3D CNN architecture, predicts the ISUP grade of renal cell carcinoma tumors
linked to mortality rates from CT images. A selection of clinical variables is
systematically chosen using the Spearman score and random forest importance
score as criteria. A deep learning-based network, trained with discrete
LogisticHazard-based loss, performs the survival prediction. Nine distinct
experiments are performed, with varying numbers of clinical variables
determined by different thresholds of the Spearman and importance scores. Our
findings demonstrate that the proposed strategy surpasses the current
literature on renal cancer prognosis based on CT scans and clinical factors.
The best-performing experiment yielded a concordance index of 0.84 and an area
under the curve value of 0.8 on the test cohort, which suggests strong
predictive power. The multimodal deep-learning approach developed in this study
shows promising results in estimating survival probabilities for renal cell
carcinoma patients using CT imaging and clinical data. This may have potential
implications in identifying patients who require urgent treatment, potentially
improving patient outcomes. The code created for this project is available for
the public on:
\href{https://github.com/Balasingham-AI-Group/Survival_CTplusClinical}{GitHub}
- Abstract(参考訳): 腎細胞癌は生存率の低い重要な世界的な健康上の課題である。
本研究の目的は,ct画像と臨床データを統合し,先行研究で観察された限界に対処し,腎細胞癌患者の生存確率を予測できる総合的ディープラーニングモデルを開発することである。
緊急治療を要した患者の特定を容易にすることを目的としている。
提案フレームワークは,3次元画像特徴抽出器,臨床変数選択,サバイバル予測の3つのモジュールからなる。
3d cnnアーキテクチャに基づく特徴抽出モジュールは、ct画像から死亡率と関連した腎細胞癌腫瘍のisupグレードを予測する。
臨床変数の選択はSpearmanスコアとランダム森林重要度スコアを基準として体系的に選択される。
個別のgistichazardベースの損失をトレーニングしたディープラーニングベースのネットワークは、サバイバル予測を実行する。
9つの異なる実験が行われ、スピアマンの閾値と重要度によって様々な臨床変数が決定される。
以上の結果から, 腎癌予後に関する現在の文献を, ctスキャンおよび臨床因子に基づいて上回る戦略が得られた。
最高性能実験では、強い予測力を示す試験コホートにおいて、0.84の一致指数と0.8の曲線値以下の領域が得られた。
本研究で開発されたマルチモーダル深層学習手法は,ct画像と臨床データを用いて腎細胞癌患者の生存確率を推定する有望な結果を示している。
これは緊急治療を必要とする患者を同定し、患者の結果を改善させる可能性がある。
このプロジェクトのために作成されたコードは、次のように一般に公開されている。
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