論文の概要: Early Detection of COVID-19 Hotspots Using Spatio-Temporal Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.00072v1
- Date: Mon, 31 May 2021 19:28:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-02 14:31:46.769834
- Title: Early Detection of COVID-19 Hotspots Using Spatio-Temporal Data
- Title(参考訳): 時空間データによるCOVID-19ホットスポットの早期検出
- Authors: Shixiang Zhu, Alexander Bukharin, Liyan Xie, Shihao Yang, Pinar
Keskinocak, Yao Xie
- Abstract要約: 疾病予防管理センター(CDC)は他の連邦機関と協力して、新型コロナウイルス(COVID-19)の感染が増加する郡(ホットスポット)を特定する。
本稿では,米国における新型コロナウイルスホットスポットの早期発見のためのスパースモデルを提案する。
深層ニューラルネットワークは、カーネルの解釈可能性を維持しながらモデルの代表的なパワーを高めるために導入されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 66.70036251870988
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Recently, the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) has worked
with other federal agencies to identify counties with increasing coronavirus
disease 2019 (COVID-19) incidence (hotspots) and offers support to local health
departments to limit the spread of the disease. Understanding the
spatio-temporal dynamics of hotspot events is of great importance to support
policy decisions and prevent large-scale outbreaks. This paper presents a
spatio-temporal Bayesian framework for early detection of COVID-19 hotspots (at
the county level) in the United States. We assume both the observed number of
cases and hotspots depend on a class of latent random variables, which encode
the underlying spatio-temporal dynamics of the transmission of COVID-19. Such
latent variables follow a zero-mean Gaussian process, whose covariance is
specified by a non-stationary kernel function. The most salient feature of our
kernel function is that deep neural networks are introduced to enhance the
model's representative power while still enjoying the interpretability of the
kernel. We derive a sparse model and fit the model using a variational learning
strategy to circumvent the computational intractability for large data sets.
Our model demonstrates better interpretability and superior hotspot-detection
performance compared to other baseline methods.
- Abstract(参考訳): 近年、CDC(疾病対策センター)は他の政府機関と協力して、新型コロナウイルス(COVID-19)の流行(ホットスポット)が増加する郡を識別し、地域保健部門に感染拡大を制限する支援を提供している。
ホットスポットイベントの時空間的ダイナミクスを理解することは、政策決定を支援し、大規模なアウトブレイクを防ぐために非常に重要である。
本稿では,米国におけるcovid-19ホットスポット(郡レベル)の早期検出のための時空間ベイズ的枠組みを提案する。
観察された症例数とホットスポットは、新型コロナウイルスの感染の時空間的ダイナミクスをコードする潜伏確率変数のクラスに依存すると仮定する。
そのような潜在変数はゼロ平均ガウス過程に従い、共分散は非定常核関数によって指定される。
我々のカーネル関数の最も有意義な特徴は、深いニューラルネットワークが、カーネルの解釈可能性を維持しながら、モデルの代表力を高めるために導入されていることです。
分散モデルを導出し,変分学習戦略を用いてモデルに適合させることにより,大規模データセットの計算難易度を回避できる。
本モデルでは,他のベースライン法と比較して,解釈性やホットスポット検出性能が優れていることを示す。
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