論文の概要: Validating GAN-BioBERT: A Methodology For Assessing Reporting Trends In
Clinical Trials
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.00665v1
- Date: Tue, 1 Jun 2021 17:51:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-02 14:44:13.588758
- Title: Validating GAN-BioBERT: A Methodology For Assessing Reporting Trends In
Clinical Trials
- Title(参考訳): GAN-BioBERTの検証 : 臨床治験における報告傾向の評価方法
- Authors: Joshua J Myszewski, Emily Klossowski, Patrick Meyer, Kristin Bevil,
Lisa Klesius, Kristopher M Schroeder
- Abstract要約: 本研究では,半教師付き自然言語プロセスモデルを用いた臨床試験要約のための感情分類アルゴリズムを開発した。
このアルゴリズムの精度は91.3%であり、マクロF1スコアは0.92であり、従来の手法に比べて精度が大幅に向上した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.164363223464948
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: In the past decade, there has been much discussion about the issue of biased
reporting in clinical research. Despite this attention, there have been limited
tools developed for the systematic assessment of qualitative statements made in
clinical research, with most studies assessing qualitative statements relying
on the use of manual expert raters, which limits their size. Also, previous
attempts to develop larger scale tools, such as those using natural language
processing, were limited by both their accuracy and the number of categories
used for the classification of their findings. With these limitations in mind,
this study's goal was to develop a classification algorithm that was both
suitably accurate and finely grained to be applied on a large scale for
assessing the qualitative sentiment expressed in clinical trial abstracts.
Additionally, this study seeks to compare the performance of the proposed
algorithm, GAN-BioBERT, to previous studies as well as to expert manual rating
of clinical trial abstracts. This study develops a three-class sentiment
classification algorithm for clinical trial abstracts using a semi-supervised
natural language process model based on the Bidirectional Encoder
Representation from Transformers (BERT) model, from a series of clinical trial
abstracts annotated by a group of experts in academic medicine. Results: The
use of this algorithm was found to have a classification accuracy of 91.3%,
with a macro F1-Score of 0.92, which is a significant improvement in accuracy
when compared to previous methods and expert ratings, while also making the
sentiment classification finer grained than previous studies. The proposed
algorithm, GAN-BioBERT, is a suitable classification model for the large-scale
assessment of qualitative statements in clinical trial literature, providing an
accurate, reproducible tool for the large-scale study of clinical publication
trends.
- Abstract(参考訳): 過去10年間、臨床研究におけるバイアスド・レポーティングの問題について多くの議論がなされてきた。
この点にも拘わらず、臨床研究における質的記述の体系的評価のための限られたツールが開発されており、ほとんどの研究は、その大きさを制限する手作業のエキスパート・リサーの使用に依拠して質的記述を評価する。
また、自然言語処理などの大規模ツール開発の試みは、その精度と発見の分類に使用されるカテゴリ数によって制限されていた。
これらの制約を念頭に置いて、臨床試験の要約で表される定性的な感情を評価するために、大規模に適用するには適度に正確かつきめ細かな分類アルゴリズムを開発することが本研究の目的であった。
さらに,本研究では,提案アルゴリズムであるGAN-BioBERTと過去の研究との比較や,臨床治験要約のマニュアル評価について検討する。
本研究は,トランスフォーマー(bert)モデルからの双方向エンコーダ表現に基づく半教師自然言語プロセスモデルを用いて,臨床実施例の3種類の感情分類アルゴリズムを開発した。
結果: このアルゴリズムを用いた場合, 分類精度は91.3%であり, マクロf1-scoreは0.92であり, 従来の方法やエキスパート格付けに比べ, 精度が大幅に向上した。
提案手法であるgan-biobertは, 臨床文献における質的記述の大規模評価に適した分類モデルであり, 臨床出版動向の大規模研究に正確な再現性を提供する。
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