論文の概要: A multi-centre polyp detection and segmentation dataset for
generalisability assessment
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.04463v3
- Date: Fri, 19 May 2023 09:10:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-05-22 20:21:53.616170
- Title: A multi-centre polyp detection and segmentation dataset for
generalisability assessment
- Title(参考訳): 汎用性評価のための多心ポリープ検出とセグメンテーションデータセット
- Authors: Sharib Ali, Debesh Jha, Noha Ghatwary, Stefano Realdon, Renato
Cannizzaro, Osama E. Salem, Dominique Lamarque, Christian Daul, Michael A.
Riegler, Kim V. Anonsen, Andreas Petlund, P{\aa}l Halvorsen, Jens Rittscher,
Thomas de Lange, and James E. East
- Abstract要約: このデータセットは、3762個のアノテートされたポリプラベルを持つ単一フレームとシーケンスデータの両方を含む。
本論文は,データ構築とアノテーション戦略,品質保証,技術検証に関する知見を提供する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.5661270644639687
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Polyps in the colon are widely known cancer precursors identified by
colonoscopy. Whilst most polyps are benign, the polyp's number, size and
surface structure are linked to the risk of colon cancer. Several methods have
been developed to automate polyp detection and segmentation. However, the main
issue is that they are not tested rigorously on a large multicentre
purpose-built dataset, one reason being the lack of a comprehensive public
dataset. As a result, the developed methods may not generalise to different
population datasets. To this extent, we have curated a dataset from six unique
centres incorporating more than 300 patients. The dataset includes both single
frame and sequence data with 3762 annotated polyp labels with precise
delineation of polyp boundaries verified by six senior gastroenterologists. To
our knowledge, this is the most comprehensive detection and pixel-level
segmentation dataset (referred to as \textit{PolypGen}) curated by a team of
computational scientists and expert gastroenterologists. The paper provides
insight into data construction and annotation strategies, quality assurance,
and technical validation. Our dataset can be downloaded from \url{
https://doi.org/10.7303/syn26376615}.
- Abstract(参考訳): 大腸ポリープは大腸内視鏡で同定されたがん前駆体として広く知られている。
ほとんどのポリープは良性であるが、ポリープの数、サイズ、表面構造は大腸癌のリスクと関連している。
ポリープ検出とセグメンテーションを自動化するいくつかの方法が開発されている。
しかし、主な問題は、大規模なマルチセンタで構築されたデータセットで厳密にテストされていないことである。
その結果、開発した手法は、異なる集団データセットに一般化できない。
この範囲で、300人以上の患者を対象とする6つのユニークなセンターからデータセットを収集した。
このデータセットは、3762個のアノテートされたポリプラベルを持つ単一フレームとシーケンスデータの両方を含む。
我々の知る限り、これは最も包括的な検出とピクセルレベルのセグメンテーションデータセット(「textit{PolypGen}」と呼ばれる)であり、計算科学者と専門の消化器科医のチームが計算した。
本稿では,データ構築とアノテーション戦略,品質保証,技術検証に関する知見を提供する。
我々のデータセットは \url{ https://doi.org/10.7303/syn26376615} からダウンロードできる。
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