論文の概要: Deep Open Snake Tracker for Vessel Tracing
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.09049v1
- Date: Mon, 19 Jul 2021 17:59:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-20 15:07:53.023767
- Title: Deep Open Snake Tracker for Vessel Tracing
- Title(参考訳): 容器トラクション用ディープオープンスネークトラッカー
- Authors: Li Chen, Wenjin Liu, Niranjan Balu, Mahmud Mossa-Basha, Thomas S.
Hatsukami, Jenq-Neng Hwang, Chun Yuan
- Abstract要約: 中心線と半径を持つ3次元医用画像の血管構造をモデル化した血管トレースは、血管の健康に有用な情報を提供することができる。
既存のアルゴリズムは開発されているが、不完全または不正確な容器追跡のような永続的な問題もある。
本稿では3次元画像中の容器をトレースする深層学習に基づく開曲線アクティブな輪郭モデル(DOST)を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 32.97987423431042
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Vessel tracing by modeling vascular structures in 3D medical images with
centerlines and radii can provide useful information for vascular health.
Existing algorithms have been developed but there are certain persistent
problems such as incomplete or inaccurate vessel tracing, especially in
complicated vascular beds like the intracranial arteries. We propose here a
deep learning based open curve active contour model (DOST) to trace vessels in
3D images. Initial curves were proposed from a centerline segmentation neural
network. Then data-driven machine knowledge was used to predict the stretching
direction and vessel radius of the initial curve, while the active contour
model (as human knowledge) maintained smoothness and intensity fitness of
curves. Finally, considering the nonloop topology of most vasculatures,
individually traced vessels were connected into a tree topology by applying a
minimum spanning tree algorithm on a global connection graph. We evaluated DOST
on a Time-of-Flight (TOF) MRA intracranial artery dataset and demonstrated its
superior performance over existing segmentation-based and tracking-based vessel
tracing methods. In addition, DOST showed strong adaptability on different
imaging modalities (CTA, MR T1 SPACE) and vascular beds (coronary arteries).
- Abstract(参考訳): 3次元医用画像における血管構造のモデル化による血管の追跡は、血管の健康に有用な情報を提供することができる。
既存のアルゴリズムは開発されているが、特に頭蓋内動脈のような複雑な血管床では、不完全または不正確な血管の追跡のような永続的な問題が存在する。
本稿では3次元画像中の容器をトレースする深層学習に基づく開曲線アクティブな輪郭モデル(DOST)を提案する。
中心線セグメンテーションニューラルネットワークから初期曲線を提案した。
次に、データ駆動型機械知識を用いて初期曲線の伸び方向と血管半径を予測し、アクティブな輪郭モデル(人間の知識として)は曲線の滑らかさと強度の適合性を維持した。
最後に,ほとんどの血管の非ループトポロジーを考慮し,大域接続グラフに最小スパンニング木アルゴリズムを適用して,個別にトレースした容器を木トポロジーに接続した。
Time-of-Flight (TOF) MRA(Time-of-Flight)の頭蓋内動脈データセットを用いてDOSTを評価し,既存のセグメンテーションおよび追跡に基づく血管追跡法よりも優れた性能を示した。
さらに, DOSTは, 異なる画像モダリティ (CTA, MR T1 SPACE) と血管底 (冠動脈) に強い適応性を示した。
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