論文の概要: Improved-Mask R-CNN: Towards an Accurate Generic MSK MRI instance
segmentation platform (Data from the Osteoarthritis Initiative)
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.12889v1
- Date: Tue, 27 Jul 2021 15:41:31 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-28 14:48:37.954710
- Title: Improved-Mask R-CNN: Towards an Accurate Generic MSK MRI instance
segmentation platform (Data from the Osteoarthritis Initiative)
- Title(参考訳): Improved-Mask R-CNN:to toward acurate Generic MSK MRI instance segmentation platform (Data from theartharthritis Initiative)
- Authors: Banafshe Felfeliyan, Abhilash Hareendranathan, Gregor Kuntze, Jacob L.
Jaremko, Janet L. Ronsky
- Abstract要約: 本研究は, OA関連組織に対するより正確な一般化セグメンテーションを得るために, Mask R-CNNインスタンスセグメンテーションをデプロイし, 改良した(改良した-Mask R-CNN)。
変形性股関節症(OAI)データセットから得られた500個のMRI膝と97個のMRIスキャンを用いて,この方法の訓練と評価を行った。
iMaskRCNNは,大腿骨の95%から98%に,大腿骨の95%から97%に,大腿骨軟骨の71%から80%に,大腿骨軟骨の81%から82%に,骨と軟骨のセグメンテーションを改善した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.0499611180329804
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Objective assessment of Magnetic Resonance Imaging (MRI) scans of
osteoarthritis (OA) can address the limitation of the current OA assessment.
Segmentation of bone, cartilage, and joint fluid is necessary for the OA
objective assessment. Most of the proposed segmentation methods are not
performing instance segmentation and suffer from class imbalance problems. This
study deployed Mask R-CNN instance segmentation and improved it (improved-Mask
R-CNN (iMaskRCNN)) to obtain a more accurate generalized segmentation for
OA-associated tissues. Training and validation of the method were performed
using 500 MRI knees from the Osteoarthritis Initiative (OAI) dataset and 97 MRI
scans of patients with symptomatic hip OA. Three modifications to Mask R-CNN
yielded the iMaskRCNN: adding a 2nd ROIAligned block, adding an extra decoder
layer to the mask-header, and connecting them by a skip connection. The results
were assessed using Hausdorff distance, dice score, and coefficients of
variation (CoV). The iMaskRCNN led to improved bone and cartilage segmentation
compared to Mask RCNN as indicated with the increase in dice score from 95% to
98% for the femur, 95% to 97% for tibia, 71% to 80% for femoral cartilage, and
81% to 82% for tibial cartilage. For the effusion detection, dice improved with
iMaskRCNN 72% versus MaskRCNN 71%. The CoV values for effusion detection
between Reader1 and Mask R-CNN (0.33), Reader1 and iMaskRCNN (0.34), Reader2
and Mask R-CNN (0.22), Reader2 and iMaskRCNN (0.29) are close to CoV between
two readers (0.21), indicating a high agreement between the human readers and
both Mask R-CNN and iMaskRCNN. Mask R-CNN and iMaskRCNN can reliably and
simultaneously extract different scale articular tissues involved in OA,
forming the foundation for automated assessment of OA. The iMaskRCNN results
show that the modification improved the network performance around the edges.
- Abstract(参考訳): 変形性関節症(OA)のMRI画像の客観的評価は,現在のOA評価の限界に対処できる。
OA客観的評価には骨,軟骨,関節液の分別が必要である。
提案するセグメンテーション手法の多くはインスタンスセグメンテーションを実行せず、クラス不均衡の問題に悩まされている。
本研究は, OA関連組織に対するより正確な一般化セグメンテーションを得るために, Mask R-CNNインスタンスセグメンテーションを導入し, 改良したMask R-CNN (iMaskRCNN) を開発した。
変形性股関節症(OAI)データセットから得られた500個のMRI膝と97個のMRIスキャンを用いて,この方法の訓練と評価を行った。
Mask R-CNNの3つの変更により、iMaskRCNNは2nd ROIAlignedブロックを追加し、マスクヘッダに余分なデコーダ層を追加し、スキップ接続で接続した。
結果は,ハウスドルフ距離,ダイススコア,変動係数(cov)を用いて評価した。
iMaskRCNNは, 大腿骨の95%から98%, 大腿骨の95%から97%, 大腿骨軟骨の71%から80%, 骨軟骨の81%から82%に増加していた。
拡散検出では,iMaskRCNNは72%,MaskRCNNは71%で改善した。
Reader1とMask R-CNN(0.33)、Reader1とiMaskRCNN(0.34)、Reader2とMask R-CNN(0.22)、Reader2とiMaskRCNN(0.29)間の拡散検出のCoV値は2つのリーダー(0.21)間のCoVに近い。
Mask R-CNNとiMaskRCNNは、OAに関与する異なるスケールの関節組織を確実かつ同時に抽出し、OAの自動評価の基礎となる。
iMaskRCNNの結果は、エッジ周辺のネットワーク性能を改善したことを示している。
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