論文の概要: Excited state, non-adiabatic dynamics of large photoswitchable molecules
using a chemically transferable machine learning potential
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2108.04879v1
- Date: Tue, 10 Aug 2021 19:03:36 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-08-12 21:19:07.904355
- Title: Excited state, non-adiabatic dynamics of large photoswitchable molecules
using a chemically transferable machine learning potential
- Title(参考訳): 化学転写可能な機械学習電位を用いた大型フォトウィッチブル分子の励起状態、非断熱動力学
- Authors: Simon Axelrod, Eugene Shakhnovich, Rafael G\'omez-Bombarelli
- Abstract要約: 我々はアゾベンゼン誘導体のシミュレーションを加速するニューラルネットワークポテンシャルを導入する。
ネットワークは、トレーニングに使用される量子化学法よりも6桁高速である。
このモデルを用いて、仮想的に3,100個の仮説分子をスクリーニングし、非常に高い量子収率を持ついくつかの種を同定する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Light-induced chemical processes are ubiquitous in nature and have widespread
technological applications. For example, the photoisomerization of azobenzene
allows a drug with an azo scaffold to be activated with light. In principle,
photoswitches with useful reactive properties, such as high isomerization
yields, can be identified through virtual screening with reactive simulations.
In practice these simulations are rarely used for screening, since they require
hundreds of trajectories and expensive quantum chemical methods to account for
non-adiabatic excited state effects. Here we introduce a neural network
potential to accelerate such simulations for azobenzene derivatives. The model,
which is based on diabatic states, is called the \textit{diabatic artificial
neural network} (DANN). The network is six orders of magnitude faster than the
quantum chemistry method used for training. DANN is transferable to molecules
outside the training set, predicting quantum yields for unseen species that are
correlated with experiment. We use the model to virtually screen 3,100
hypothetical molecules, and identify several species with extremely high
quantum yields. Our results pave the way for fast and accurate virtual
screening of photoactive compounds.
- Abstract(参考訳): 光誘起化学プロセスは自然界に広く存在し、幅広い技術応用がある。
例えば、アゾベンゼンの光異性化により、アゾ骨格を持つ薬物が光で活性化される。
原則として、高い異性化収率などの有用な反応性特性を持つフォトウィッチは、反応性シミュレーションによる仮想スクリーニングによって識別できる。
実際には、これらのシミュレーションは、非断熱励起状態効果を説明するために数百の軌道と高価な量子化学法を必要とするため、スクリーニングにはほとんど使われない。
本稿では,アゾベンゼン誘導体のシミュレーションを高速化するニューラルネットワークポテンシャルを提案する。
このモデルは、ダイアバティック状態に基づくもので、 \textit{diabatic Artificial Neural Network} (DANN) と呼ばれる。
ネットワークは、トレーニングに使用される量子化学法よりも6桁高速である。
DANNはトレーニングセット外の分子に転送可能であり、実験と相関する未確認種の量子収率を予測する。
このモデルを用いて、仮想的に3100個の仮説分子をスクリーニングし、非常に高い量子収率を持ついくつかの種を同定する。
以上の結果から,光活性化合物の高速かつ高精度な仮想スクリーニングが可能となった。
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