論文の概要: Simultaneous Nuclear Instance and Layer Segmentation in Oral Epithelial
Dysplasia
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2108.13904v1
- Date: Tue, 31 Aug 2021 15:02:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-01 14:24:14.065752
- Title: Simultaneous Nuclear Instance and Layer Segmentation in Oral Epithelial
Dysplasia
- Title(参考訳): 口腔上皮異形成における核発生と層分画の同時解析
- Authors: Adam J. Shephard, Simon Graham, R.M. Saad Bashir, Mostafa Jahanifar,
Hanya Mahmood, Syed Ali Khurram, Nasir M. Rajpoot
- Abstract要約: HoVer-Net+は、OEDケースからH&E染色スライディングスライドにおいて、核と(内部の)上皮層を同時に分割(分類)するディープラーニングフレームワークである。
提案手法は,各タスクに対する従来のSOTA手法と比較して,コストを伴わずに,両タスクにおけるSOTA(State-of-the-art)性能を実現することを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.440137399521785
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Oral epithelial dysplasia (OED) is a pre-malignant histopathological
diagnosis given to lesions of the oral cavity. Predicting OED grade or whether
a case will transition to malignancy is critical for early detection and
appropriate treatment. OED typically begins in the lower third of the
epithelium before progressing upwards with grade severity, thus we have
suggested that segmenting intra-epithelial layers, in addition to individual
nuclei, may enable researchers to evaluate important layer-specific
morphological features for grade/malignancy prediction. We present HoVer-Net+,
a deep learning framework to simultaneously segment (and classify) nuclei and
(intra-)epithelial layers in H&E stained slides from OED cases. The proposed
architecture consists of an encoder branch and four decoder branches for
simultaneous instance segmentation of nuclei and semantic segmentation of the
epithelial layers. We show that the proposed model achieves the
state-of-the-art (SOTA) performance in both tasks, with no additional costs
when compared to previous SOTA methods for each task. To the best of our
knowledge, ours is the first method for simultaneous nuclear instance
segmentation and semantic tissue segmentation, with potential for use in
computational pathology for other similar simultaneous tasks and for future
studies into malignancy prediction.
- Abstract(参考訳): 口腔上皮性異形成症(OED)は,口腔病変に対する術前の病理組織学的診断である。
早期発見と適切な治療には, oedグレードの予測や悪性腫瘍への移行が不可欠である。
OEDは典型的に上皮の下部3分の1から順に進行し, 硬度で進行するので, 個々の核に加え, 上皮内層を分断することで, 悪性度予測に重要な層特異的な形態的特徴を評価できる可能性が示唆された。
深層学習フレームワークHoVer-Net+について,H&Eステンディングスライディングスライディングスライディングスにおける原子核と層間(層間)を同時に分割し,分類する。
提案するアーキテクチャは、エンコーダブランチと4つのデコーダブランチで構成され、核のインスタンスセグメンテーションと上皮層のセマンティックセグメンテーションを同時に行う。
提案手法は,従来の sota 法と比較してコストを増すことなく,両タスクの最先端 (sota) 性能を実現することを示す。
我々の知識を最大限に活用するために、我々の研究は、他の類似した同時タスクの計算病理学や、悪性度予測の今後の研究に応用可能な、核インスタンス分割とセマンティック組織分割を同時に行うための最初の方法である。
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