論文の概要: Assessing domain adaptation techniques for mitosis detection in
multi-scanner breast cancer histopathology images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.00869v1
- Date: Wed, 1 Sep 2021 16:27:46 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-03 13:47:19.035791
- Title: Assessing domain adaptation techniques for mitosis detection in
multi-scanner breast cancer histopathology images
- Title(参考訳): マルチスキャン乳癌病理組織像におけるmitosis検出のためのドメイン適応法の検討
- Authors: Jack Breen, Kieran Zucker, Nicolas Orsi, Geoff Hall, Nishant Ravikumar
- Abstract要約: 2つのミトーシス検出モデルと2つのスタイル転送法を訓練し、ミトーシス検出性能を向上させるために後者の有用性を評価する。
これらの最も優れたU-Netは、MIDOG 2021の予備テストセットでF1スコア0.693を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.6999740786886536
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Breast cancer is the most prevalent cancer worldwide and over two million new
cases are diagnosed each year. As part of the tumour grading process,
histopathologists manually count how many cells are dividing, in a biological
process called mitosis. Artificial intelligence (AI) methods have been
developed to automatically detect mitotic figures, however these methods often
perform poorly when applied to data from outside of the original (training)
domain, i.e. they do not generalise well to histology images created using
varied staining protocols or digitised using different scanners. Style
transfer, a form of domain adaptation, provides the means to transform images
from different domains to a shared visual appearance and have been adopted in
various applications to mitigate the issue of domain shift. In this paper we
train two mitosis detection models and two style transfer methods and evaluate
the usefulness of the latter for improving mitosis detection performance in
images digitised using different scanners. We found that the best of these
models, U-Net without style transfer, achieved an F1-score of 0.693 on the
MIDOG 2021 preliminary test set.
- Abstract(参考訳): 乳がんは世界で最も多いがんであり、毎年200万人以上の新しい症例が診断されている。
腫瘍の診断プロセスの一環として、病理組織学者は細胞分裂の回数を細胞分裂と呼ばれる生物学的プロセスで手動で計算する。
人工知能(AI)法は、有糸分裂図形を自動的に検出する手法が開発されているが、元の(訓練)領域外からのデータに適用した場合、しばしば性能が低下する。
異なる染色プロトコルを用いて作成された組織像や、異なるスキャナを用いてデジタル化されたヒストロジー画像にうまく一般化していない。
ドメイン適応の形式であるスタイル転送は、異なるドメインから共有の視覚的外観にイメージを変換する手段を提供し、ドメインシフトの問題を軽減するために様々なアプリケーションで採用されている。
本稿では,2つのmitosis検出モデルと2つのスタイル転送法を訓練し,異なるスキャナを用いてデジタル化された画像におけるmitosis検出性能を向上させるための後者の有用性を評価する。
その結果,MIDOG 2021の予備テストセットでは,これらのモデルの中で最も優れたU-Netが0.693のF1スコアを達成した。
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