論文の概要: Leveraging Clinical Characteristics for Improved Deep Learning-Based
Kidney Tumor Segmentation on CT
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.05816v1
- Date: Mon, 13 Sep 2021 09:38:22 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-14 15:20:37.562681
- Title: Leveraging Clinical Characteristics for Improved Deep Learning-Based
Kidney Tumor Segmentation on CT
- Title(参考訳): 深層学習に基づく腎腫瘍のCT診断における臨床応用
- Authors: Christina B. Lund, Bas H. M. van der Velden
- Abstract要約: 本研究は, 腎癌の自動分節化を画像診断に加え, 臨床的特徴を用いることで改善できるかどうかを考察する。
造影CT検査および臨床像を施行した腎癌患者300名を含む。
セグメンテーションの改善のために臨床特性を活用するために,認識型サンプリング戦略が用いられた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: This paper assesses whether using clinical characteristics in addition to
imaging can improve automated segmentation of kidney cancer on
contrast-enhanced computed tomography (CT). A total of 300 kidney cancer
patients with contrast-enhanced CT scans and clinical characteristics were
included. A baseline segmentation of the kidney cancer was performed using a 3D
U-Net. Input to the U-Net were the contrast-enhanced CT images, output were
segmentations of kidney, kidney tumors, and kidney cysts. A cognizant sampling
strategy was used to leverage clinical characteristics for improved
segmentation. To this end, a Least Absolute Shrinkage and Selection Operator
(LASSO) was used. Segmentations were evaluated using Dice and Surface Dice.
Improvement in segmentation was assessed using Wilcoxon signed rank test. The
baseline 3D U-Net showed a segmentation performance of 0.90 for kidney and
kidney masses, i.e., kidney, tumor, and cyst, 0.29 for kidney masses, and 0.28
for kidney tumor, while the 3D U-Net trained with cognizant sampling enhanced
the segmentation performance and reached Dice scores of 0.90, 0.39, and 0.38
respectively. To conclude, the cognizant sampling strategy leveraging the
clinical characteristics significantly improved kidney cancer segmentation.
- Abstract(参考訳): 造影CT(Contrat-enhanced Computed Tomography)を用いて, 腎癌の自動分節化を改善できるかどうかを検討した。
造影ct検査を施行した300例の腎癌患者と臨床的特徴について検討した。
3D U-Netを用いて腎癌の基準線分画を行った。
U-Netへの入力は造影CT像で, 出力は腎, 腎腫瘍, 腎嚢胞の分画であった。
セグメンテーションの改善のために臨床特性を活用するための認識サンプリング戦略が用いられた。
この目的のために、Last Absolute Shrinkage and Selection Operator(LASSO)が使用された。
セグメンテーションはdiceとsurface diceを用いて評価した。
セグメンテーションの改善はウィルコクソン符号ランクテストを用いて評価された。
3d u-netでは, 腎臓, 腎臓, 腫瘍, 嚢胞の0.90, 腎臓質量の0.29, 腎臓腫瘍の0.28, 認識サンプリングで訓練した3d u-netがそれぞれ0.90, 0.39, 0.38のdiceスコアに達した。
以上より, 臨床特性を活かした検体採取戦略は, 腎癌分画を著しく改善した。
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