論文の概要: GERNERMED -- An Open German Medical NER Model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.12104v1
- Date: Fri, 24 Sep 2021 17:53:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-27 14:29:21.059762
- Title: GERNERMED -- An Open German Medical NER Model
- Title(参考訳): GERNERMED - ドイツのオープン医療ナーモデル。
- Authors: Johann Frei and Frank Kramer
- Abstract要約: 医療データ分析の分野でのデータマイニングは、関連するデータを取得するために、構造化されていないデータの処理にのみ依存する必要があることが多い。
本研究では,ドイツのテキストデータにおける医学的実体型を検出するためのNERタスクのための,最初のオープンなニューラルNLPモデルであるGERNERMEDを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7310043452300736
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: The current state of adoption of well-structured electronic health records
and integration of digital methods for storing medical patient data in
structured formats can often considered as inferior compared to the use of
traditional, unstructured text based patient data documentation. Data mining in
the field of medical data analysis often needs to rely solely on processing of
unstructured data to retrieve relevant data. In natural language processing
(NLP), statistical models have been shown successful in various tasks like
part-of-speech tagging, relation extraction (RE) and named entity recognition
(NER). In this work, we present GERNERMED, the first open, neural NLP model for
NER tasks dedicated to detect medical entity types in German text data. Here,
we avoid the conflicting goals of protection of sensitive patient data from
training data extraction and the publication of the statistical model weights
by training our model on a custom dataset that was translated from publicly
available datasets in foreign language by a pretrained neural machine
translation model. The sample code and the statistical model is available at:
https://github.com/frankkramer-lab/GERNERMED
- Abstract(参考訳): 構造化された電子カルテの採用状況や、構造化されたフォーマットで医療データを保存するためのデジタル手法の統合は、従来の非構造化されたテキストベースの患者データドキュメントの使用よりも劣ると考えられることが多い。
医療データ分析の分野でのデータマイニングは、関連するデータを取得するために、構造化されていないデータの処理にのみ依存する必要があることが多い。
自然言語処理(NLP)では、音声タグ付け、関係抽出(RE)、名前付きエンティティ認識(NER)といった様々なタスクで統計モデルが成功している。
本稿では,ドイツのテキストデータから医学的エンティティタイプを検出するためのnerタスクのための,最初のニューラルネットワークnlpモデルであるgernermedを提案する。
本稿では,神経機械翻訳モデルによって外国語の公開データセットから翻訳されたカスタムデータセット上でモデルをトレーニングすることにより,センシティブな患者データのトレーニングデータ抽出と統計モデルの重み付けから保護するという矛盾する目標を回避する。
サンプルコードと統計モデルは、https://github.com/frankkramer-lab/GERNERMED
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