論文の概要: Learning of Inter-Label Geometric Relationships Using Self-Supervised
Learning: Application To Gleason Grade Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.00404v1
- Date: Fri, 1 Oct 2021 13:47:07 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-04 14:28:00.413422
- Title: Learning of Inter-Label Geometric Relationships Using Self-Supervised
Learning: Application To Gleason Grade Segmentation
- Title(参考訳): 自己監督学習を用いたラベル間幾何関係の学習:グリーソングレードセグメンテーションへの応用
- Authors: Dwarikanath Mahapatra
- Abstract要約: そこで本研究では,PCaの病理組織像に対して,異なる疾患ラベル間の幾何学的関係を学習して合成する方法を提案する。
我々はGleasonスコアを用いた弱教師付きセグメンテーション手法を用いて、疾患領域をセグメンテーションする。
得られたセグメンテーションマップは、行方不明のマスクセグメントを予測するためにShaRe-Net(ShaRe-Net)をトレーニングするために使用される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.898744396854313
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Segmentation of Prostate Cancer (PCa) tissues from Gleason graded
histopathology images is vital for accurate diagnosis. Although deep learning
(DL) based segmentation methods achieve state-of-the-art accuracy, they rely on
large datasets with manual annotations. We propose a method to synthesize for
PCa histopathology images by learning the geometrical relationship between
different disease labels using self-supervised learning. We use a weakly
supervised segmentation approach that uses Gleason score to segment the
diseased regions and the resulting segmentation map is used to train a Shape
Restoration Network (ShaRe-Net) to predict missing mask segments in a
self-supervised manner. Using DenseUNet as the backbone generator architecture
we incorporate latent variable sampling to inject diversity in the image
generation process and thus improve robustness. Experiments on multiple
histopathology datasets demonstrate the superiority of our method over
competing image synthesis methods for segmentation tasks. Ablation studies show
the benefits of integrating geometry and diversity in generating high-quality
images, and our self-supervised approach with limited class-labeled data
achieves similar performance as fully supervised learning.
- Abstract(参考訳): 前立腺癌(PCa)の病理組織像からの分離は正確な診断には不可欠である。
ディープラーニング(DL)ベースのセグメンテーション手法は最先端の精度を実現するが、手動アノテーションによる大規模なデータセットに依存している。
自己教師付き学習を用いて異なる疾患ラベル間の幾何学的関係を学習し,pca病理組織像の合成法を提案する。
我々は、Gleasonスコアを用いて病気領域のセグメンテーションを行い、その結果のセグメンテーションマップを用いて形状復元ネットワーク(ShaRe-Net)を訓練し、欠損マスクセグメントを自己管理的に予測する。
DenseUNetをバックボーンジェネレータアーキテクチャとして使用し、画像生成プロセスの多様性を注入し、ロバスト性を改善するために潜時変数サンプリングを組み込む。
複数の病理組織学データセットを用いた実験により,セグメンテーション課題に対する画像合成法よりも優れた方法が示された。
アブレーション研究は,高品質画像の生成における幾何学と多様性の統合の利点を示し,クラスラベルデータに制限のある自己教師付きアプローチは,完全な教師付き学習と同等の性能を達成している。
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