論文の概要: Optic Disc Segmentation using Disk-Centered Patch Augmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.00512v1
- Date: Fri, 1 Oct 2021 16:25:45 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-04 14:38:56.342715
- Title: Optic Disc Segmentation using Disk-Centered Patch Augmentation
- Title(参考訳): Disk-Centered Patch Augmentation を用いた光学ディスク分割
- Authors: Saeid Motevali, Aashis Khanal, and Rolando Estrada
- Abstract要約: Disc-centered patch augmentation (DCPA) は、ディープニューラルネットワークのための単純だが斬新なトレーニングスキームである。
DCPAは、小さなニューラルネットワークを使用しても、フルサイズの画像に対して最先端の結果を達成する。
我々は5つの網膜データセット上でDCPAトレーニングネットワークをテストした。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The optic disc is a crucial diagnostic feature in the eye since changes to
its physiognomy is correlated with the severity of various ocular and
cardiovascular diseases. While identifying the bulk of the optic disc in a
color fundus image is straightforward, accurately segmenting its boundary at
the pixel level is very challenging. In this work, we propose disc-centered
patch augmentation (DCPA) -- a simple, yet novel training scheme for deep
neural networks -- to address this problem. DCPA achieves state-of-the-art
results on full-size images even when using small neural networks, specifically
a U-Net with only 7 million parameters as opposed to the original 31 million.
In DCPA, we restrict the training data to patches that fully contain the optic
nerve. In addition, we also train the network using dynamic cost functions to
increase its robustness. We tested DCPA-trained networks on five retinal
datasets: DRISTI, DRIONS-DB, DRIVE, AV-WIDE, and CHASE-DB. The first two had
available optic disc ground truth, and we manually estimated the ground truth
for the latter three. Our approach achieved state-of-the-art F1 and IOU results
on four datasets (95 % F1, 91 % IOU on DRISTI; 92 % F1, 84 % IOU on DRIVE; 83 %
F1, 71 % IOU on AV-WIDE; 83 % F1, 71 % IOU on CHASEDB) and competitive results
on the fifth (95 % F1, 91 % IOU on DRIONS-DB), confirming its generality. Our
open-source code and ground-truth annotations are available at:
https://github.com/saeidmotevali/fundusdisk
- Abstract(参考訳): 光ディスクは、様々な眼疾患や心臓血管疾患の重症度と相関するため、眼科領域において重要な診断特徴である。
光学ディスクの大部分をカラーファウンス画像で識別するのは簡単だが、その境界線をピクセルレベルで正確に区分するのは非常に難しい。
本研究では,この問題を解決するために,深層ニューラルネットワークのための単純かつ新規なトレーニングスキームであるディスク中心パッチ強化(dcpa)を提案する。
DCPAは、小さなニューラルネットワーク、特に700万のパラメータしか持たないU-Netを使用しても、フルサイズの画像に対して最先端の結果を達成する。
DCPAでは、トレーニングデータを視神経を完全に含むパッチに制限する。
さらに,ネットワークのロバスト性を高めるために動的コスト関数を用いてネットワークをトレーニングする。
DRISTI,DRIONS-DB,DRIVE,AV-WIDE,CHASE-DBの5つの網膜データセット上でDCPAトレーニングネットワークを試験した。
最初の2つは光学ディスク基底真理を入手でき、我々は手動で後者の3つの基底真理を推定した。
提案手法は, DRISTI では 95 % F1, 91 % IOU ,DRIVE では 92 % F1, 84 % IOU ,AV-WIDE では 83 % F1, 71 % IOU ,CHASEDB では 83 % F1, 71 % IOU の4つのデータセット(DRISTI では 95 % F1, 91 % IOU ,DRIONS-DB では 91 % の IOU の一般性が確認された。
当社のオープンソースコードと基盤となるアノテーションは、https://github.com/saeidmotevali/fundusdiskで利用可能です。
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