論文の概要: Fully Automatic Intervertebral Disc Segmentation Using Multimodal 3D
U-Net
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2009.13583v1
- Date: Mon, 28 Sep 2020 18:58:24 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-13 22:23:58.553164
- Title: Fully Automatic Intervertebral Disc Segmentation Using Multimodal 3D
U-Net
- Title(参考訳): マルチモーダル3次元U-Netを用いた完全自動椎間板分割
- Authors: Chuanbo Wang, Ye Guo, Wei Chen, Zeyun Yu
- Abstract要約: 本稿では,MRI画像からIVDを分割する3次元U-Netに基づく新しい畳み込みフレームワークを提案する。
まず、各脊椎標本において椎間板の中心を局在させ、その後、局所化された椎間板を中心とした小体積の収穫に基づいてネットワークを訓練する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.619402990144922
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Intervertebral discs (IVDs), as small joints lying between adjacent
vertebrae, have played an important role in pressure buffering and tissue
protection. The fully-automatic localization and segmentation of IVDs have been
discussed in the literature for many years since they are crucial to spine
disease diagnosis and provide quantitative parameters in the treatment.
Traditionally hand-crafted features are derived based on image intensities and
shape priors to localize and segment IVDs. With the advance of deep learning,
various neural network models have gained great success in image analysis
including the recognition of intervertebral discs. Particularly, U-Net stands
out among other approaches due to its outstanding performance on biomedical
images with a relatively small set of training data. This paper proposes a
novel convolutional framework based on 3D U-Net to segment IVDs from
multi-modality MRI images. We first localize the centers of intervertebral
discs in each spine sample and then train the network based on the cropped
small volumes centered at the localized intervertebral discs. A detailed
comprehensive analysis of the results using various combinations of
multi-modalities is presented. Furthermore, experiments conducted on 2D and 3D
U-Nets with augmented and non-augmented datasets are demonstrated and compared
in terms of Dice coefficient and Hausdorff distance. Our method has proved to
be effective with a mean segmentation Dice coefficient of 89.0% and a standard
deviation of 1.4%.
- Abstract(参考訳): 椎間板 (IVDs) は, 隣接する椎間の小さな関節として, 圧緩衝や組織保護に重要な役割を果たしている。
IVDの完全自動局在とセグメンテーションは、疾患の診断と治療における定量的パラメータの提供に不可欠であるため、長年にわたって文献で議論されてきた。
伝統的に手作りの特徴は、画像強度と、IVDのローカライズとセグメント化に先立つ形状に基づいて導出される。
ディープラーニングの進歩により、さまざまなニューラルネットワークモデルが、椎間板の認識を含む画像解析で大きな成功を収めている。
特にu-netは、比較的少ないトレーニングデータを持つ生体画像において優れた性能を持つため、他のアプローチで際立っている。
本稿では,多モードMRI画像からIVDを分割する3次元U-Netに基づく新しい畳み込みフレームワークを提案する。
まず,椎間板の中心を各椎間板にローカライズし,その後,ローカライズした椎間板を中心とした切り抜かれた小体積に基づいてネットワークを訓練する。
マルチモーダルの様々な組み合わせによる結果の包括的分析について述べる。
さらに,拡張および非拡張データセットを用いた2次元および3次元U-Net実験を行い,Dice係数とハウスドルフ距離の比較を行った。
本手法は,89.0%の平均セグメンテーション係数と標準偏差1.4%で有効であることが証明された。
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