論文の概要: SurvTRACE: Transformers for Survival Analysis with Competing Events
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.00855v1
- Date: Sat, 2 Oct 2021 17:46:26 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-06 10:00:45.029293
- Title: SurvTRACE: Transformers for Survival Analysis with Competing Events
- Title(参考訳): SurvTRACE: 競合イベントによる生存分析用トランスフォーマー
- Authors: Zifeng Wang, Jimeng Sun
- Abstract要約: 医学において、生存分析は死亡などの興味のある事象の期間を研究する。
最大の課題は、複数の競合するイベントを扱う方法だ。
本稿では,基礎となる生存分布を仮定しない変圧器モデルを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 37.66291997350568
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: In medicine, survival analysis studies the time duration to events of
interest such as mortality. One major challenge is how to deal with multiple
competing events (e.g., multiple disease diagnoses). In this work, we propose a
transformer-based model that does not make the assumption for the underlying
survival distribution and is capable of handling competing events, namely
SurvTRACE. We account for the implicit \emph{confounders} in the observational
setting in multi-events scenarios, which causes selection bias as the predicted
survival probability is influenced by irrelevant factors. To sufficiently
utilize the survival data to train transformers from scratch, multiple
auxiliary tasks are designed for multi-task learning. The model hence learns a
strong shared representation from all these tasks and in turn serves for better
survival analysis. We further demonstrate how to inspect the covariate
relevance and importance through interpretable attention mechanisms of
SurvTRACE, which suffices to great potential in enhancing clinical trial design
and new treatment development. Experiments on METABRIC, SUPPORT, and SEER data
with 470k patients validate the all-around superiority of our method.
- Abstract(参考訳): 医学において、生存分析は死亡などの興味のある事象の期間を研究する。
ひとつの大きな課題は、複数の競合イベント(例えば、複数の疾患の診断)に対処する方法である。
本研究では,基礎となるサバイバル分布を仮定せず,競合するイベント,すなわちsurvtraceを処理可能なトランスフォーマティブモデルを提案する。
予測生存確率が無関係な要因によって影響を受けるため,多事象シナリオにおける観測環境における暗黙の \emph{confounders} は選択バイアスを引き起こす。
スクラッチからトランスフォーマーを訓練するために、生存データを十分に活用するために、マルチタスク学習用に複数の補助タスクを設計する。
したがって、モデルはこれらのタスクから強力な共有表現を学び、その結果、より良い生存分析に役立つ。
さらに,SurvTRACEの解釈的注意機構を通じて,臨床治験設計の強化と新たな治療開発に大きな可能性をもたらす共変量関係と重要性の検査方法を示す。
470kの患者を対象にMetaBRIC, Support, SEERデータを用いた実験を行い, 本法の有効性を検証した。
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