論文の概要: Unifying Likelihood-free Inference with Black-box Sequence Design and
Beyond
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.03372v1
- Date: Wed, 6 Oct 2021 02:41:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-08 16:12:06.722241
- Title: Unifying Likelihood-free Inference with Black-box Sequence Design and
Beyond
- Title(参考訳): Black-box Sequence DesignとBeyondによるLikelihood-free推論の統一
- Authors: Dinghuai Zhang, Jie Fu, Yoshua Bengio, Aaron Courville
- Abstract要約: 我々は、可能性のない推論とブラックボックスのシーケンス設計という、明らかに異なる2つの世界を統合することを提案する。
従来の薬物発見手法が我々のフレームワークでどのように"再発明"されるかを示し、さらに新しい確率論的シーケンス設計アルゴリズムを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 87.92360111463825
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Black-box optimization formulations for biological sequence design have drawn
recent attention due to their promising potential impact on the pharmaceutical
industry. In this work, we propose to unify two seemingly distinct worlds:
likelihood-free inference and black-box sequence design, under one
probabilistic framework. In tandem, we provide a recipe for constructing
various sequence design methods based on this framework. We show how previous
drug discovery approaches can be "reinvented" in our framework, and further
propose new probabilistic sequence design algorithms. Extensive experiments
illustrate the benefits of the proposed methodology.
- Abstract(参考訳): 生物配列設計のためのブラックボックス最適化の定式化は、製薬業界に有望な影響を及ぼす可能性から近年注目されている。
本研究では,確率的枠組みの下で,確率的推論とブラックボックスシーケンス設計という,一見異なる2つの世界を統合することを提案する。
この枠組みに基づき,様々なシーケンス設計手法を構築するためのレシピを提供する。
我々は,従来の薬物発見手法を我々の枠組みで「再発明」し,新たな確率論的シーケンス設計アルゴリズムを提案する。
大規模な実験は提案手法の利点を実証している。
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