論文の概要: Anatomical and Diagnostic Bayesian Segmentation in Prostate MRI
$-$Should Different Clinical Objectives Mandate Different Loss Functions?
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.12889v1
- Date: Mon, 25 Oct 2021 12:44:52 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-26 22:04:56.071659
- Title: Anatomical and Diagnostic Bayesian Segmentation in Prostate MRI
$-$Should Different Clinical Objectives Mandate Different Loss Functions?
- Title(参考訳): 前立腺mriの解剖学的および診断的ベイズ分節化は、異なる臨床目的に異なる損失機能を必要とするか?
- Authors: Anindo Saha, Joeran Bosma, Jasper Linmans, Matin Hosseinzadeh, Henkjan
Huisman
- Abstract要約: 前立腺MRIにおける解剖・悪性度のボクセルレベルの分類は, 最適な成績を得るために異なる損失関数を必要とする。
ProstateXデータセットを用いて,200件の患者試験において,各タスクの分布,領域,境界に基づく損失関数について検討した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.3149883354098941
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We hypothesize that probabilistic voxel-level classification of anatomy and
malignancy in prostate MRI, although typically posed as near-identical
segmentation tasks via U-Nets, require different loss functions for optimal
performance due to inherent differences in their clinical objectives. We
investigate distribution, region and boundary-based loss functions for both
tasks across 200 patient exams from the publicly-available ProstateX dataset.
For evaluation, we conduct a thorough comparative analysis of model predictions
and calibration, measured with respect to multi-class volume segmentation of
the prostate anatomy (whole-gland, transitional zone, peripheral zone), as well
as, patient-level diagnosis and lesion-level detection of clinically
significant prostate cancer. Notably, we find that distribution-based loss
functions (in particular, focal loss) are well-suited for diagnostic or
panoptic segmentation tasks such as lesion detection, primarily due to their
implicit property of inducing better calibration. Meanwhile, (with the
exception of focal loss) both distribution and region/boundary-based loss
functions perform equally well for anatomical or semantic segmentation tasks,
such as quantification of organ shape, size and boundaries.
- Abstract(参考訳): 前立腺MRIにおける確率的ボクセルレベルの解剖・悪性度分類は、U-Netsを介してほぼ同一のセグメンテーションタスクとして扱われることが多いが、臨床目的に固有の違いがあるため、最適性能の損失関数が要求される。
ProstateXデータセットを用いて,200件の患者試験において,各タスクの分布,領域,境界に基づく損失関数について検討した。
評価のために, 前立腺解剖学の多クラス分別(whole-gland, transitional zone, peripheral zone)および臨床的に有意な前立腺癌の患者レベル診断および病変レベル検出に関して, モデル予測とキャリブレーションの徹底的な比較分析を行った。
特に、分布に基づく損失関数(特に焦点損失)は、病変検出などの診断や汎視的セグメンテーションに適しており、その主な原因は、キャリブレーションの改善による暗黙的な特性である。
一方、(焦点損失を除く)分布関数と領域/境界に基づく損失関数は、解剖学的または意味的セグメンテーションタスク(臓器の形状、サイズ、境界の定量化など)において等しく機能する。
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