論文の概要: TA-Net: Topology-Aware Network for Gland Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.14593v1
- Date: Wed, 27 Oct 2021 17:10:58 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-28 15:14:23.541562
- Title: TA-Net: Topology-Aware Network for Gland Segmentation
- Title(参考訳): TA-Net:グランドセグメンテーションのためのトポロジー対応ネットワーク
- Authors: Haotian Wang, Min Xian, Aleksandar Vakanski
- Abstract要約: 本研究では, 密集した腺と高度に変形した腺を正確に分離する新しいトポロジ・アウェア・ネットワーク(TA-Net)を提案する。
TA-Netはマルチタスク学習アーキテクチャを持ち、腺セグメンテーションの一般化を強化する。
2つのデータセットで最先端のパフォーマンスを達成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 71.52681611057271
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Gland segmentation is a critical step to quantitatively assess the morphology
of glands in histopathology image analysis. However, it is challenging to
separate densely clustered glands accurately. Existing deep learning-based
approaches attempted to use contour-based techniques to alleviate this issue
but only achieved limited success. To address this challenge, we propose a
novel topology-aware network (TA-Net) to accurately separate densely clustered
and severely deformed glands. The proposed TA-Net has a multitask learning
architecture and enhances the generalization of gland segmentation by learning
shared representation from two tasks: instance segmentation and gland topology
estimation. The proposed topology loss computes gland topology using gland
skeletons and markers. It drives the network to generate segmentation results
that comply with the true gland topology. We validate the proposed approach on
the GlaS and CRAG datasets using three quantitative metrics, F1-score,
object-level Dice coefficient, and object-level Hausdorff distance. Extensive
experiments demonstrate that TA-Net achieves state-of-the-art performance on
the two datasets. TA-Net outperforms other approaches in the presence of
densely clustered glands.
- Abstract(参考訳): 腺分画は病理組織像解析において腺の形態を定量的に評価するための重要なステップである。
しかし、密集した腺を正確に分離することは困難である。
既存のディープラーニングベースのアプローチでは、contourベースのテクニックを使用してこの問題を緩和しようとしたが、成功は限定的だった。
この課題に対処するために,密集した腺と高度に変形した腺を正確に分離する新しいトポロジー対応ネットワーク(TA-Net)を提案する。
提案するTA-Netはマルチタスク学習アーキテクチャを備え,2つのタスクから共有表現を学習することにより,腺のセグメンテーションの一般化を促進する。
提案するトポロジー損失は腺骨格とマーカーを用いて腺トポロジーを計算する。
ネットワークを駆動して、真の腺トポロジーに準拠したセグメンテーション結果を生成する。
提案手法を,f1-score,object-level dice coefficient,object-level hausdorff distanceの3つの定量的指標を用いて検証した。
大規模な実験により、TA-Netは2つのデータセットで最先端のパフォーマンスを達成する。
TA-Netは密集した腺の存在において他のアプローチよりも優れている。
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