論文の概要: ECG synthesis with Neural ODE and GAN models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2111.00314v1
- Date: Sat, 30 Oct 2021 19:17:20 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-11-02 16:25:34.830616
- Title: ECG synthesis with Neural ODE and GAN models
- Title(参考訳): ニューラルODEとGANモデルを用いたECG合成
- Authors: Mansura Habiba, Eoin Borphy, Barak A. Pearlmutter, Tomas Ward
- Abstract要約: ECGのような連続医療時系列データは、その動的および高次元特性のために最も複雑な時系列の1つである。
本研究では,ニューラルODEモデルを用いて合成正弦波と合成心電図を生成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.8960992912176574
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Continuous medical time series data such as ECG is one of the most complex
time series due to its dynamic and high dimensional characteristics. In
addition, due to its sensitive nature, privacy concerns and legal restrictions,
it is often even complex to use actual data for different medical research. As
a result, generating continuous medical time series is a very critical research
area. Several research works already showed that the ability of generative
adversarial networks (GANs) in the case of continuous medical time series
generation is promising. Most medical data generation works, such as ECG
synthesis, are mainly driven by the GAN model and its variation. On the other
hand, Some recent work on Neural Ordinary Differential Equation (Neural ODE)
demonstrates its strength against informative missingness, high dimension as
well as dynamic nature of continuous time series. Instead of considering
continuous-time series as a discrete-time sequence, Neural ODE can train
continuous time series in real-time continuously. In this work, we used Neural
ODE based model to generate synthetic sine waves and synthetic ECG. We
introduced a new technique to design the generative adversarial network with
Neural ODE based Generator and Discriminator. We developed three new models to
synthesise continuous medical data. Different evaluation metrics are then used
to quantitatively assess the quality of generated synthetic data for real-world
applications and data analysis. Another goal of this work is to combine the
strength of GAN and Neural ODE to generate synthetic continuous medical time
series data such as ECG. We also evaluated both the GAN model and the Neural
ODE model to understand the comparative efficiency of models from the GAN and
Neural ODE family in medical data synthesis.
- Abstract(参考訳): ECGのような連続医療時系列データは、その動的および高次元特性のために最も複雑な時系列の1つである。
さらに、その繊細な性質、プライバシーの懸念、法的制限により、さまざまな医学研究に実際のデータを使うのはさらに複雑であることが多い。
その結果,連続医療時系列生成は極めて重要な研究分野である。
いくつかの研究で、連続医療時系列生成におけるGAN(Generative Adversarial Network)の能力が有望であることが示されている。
ECG合成のようなほとんどの医療データ生成は、主にGANモデルとそのバリエーションによって駆動される。
一方、ニューラル正規微分方程式(Neural ODE)に関する最近の研究は、情報不足、高次元、および連続時系列の動的性質に対するその強さを実証している。
連続時系列を離散時間列として考える代わりに、Neural ODEは連続時系列をリアルタイムにトレーニングすることができる。
本研究では,ニューラルODEモデルを用いて合成正弦波と合成心電図を生成する。
我々はニューラルODEベースジェネレータと識別器を用いた生成対向ネットワークの設計手法を導入した。
連続医療データを合成する3つの新しいモデルを開発した。
異なる評価指標を用いて、実世界のアプリケーションやデータ分析のために生成された合成データの質を定量的に評価する。
この研究のもう1つの目標は、心電図などの合成連続医療時系列データを生成するために、GANとNeural ODEの強さを組み合わせることである。
また、医療データ合成において、GANモデルとNeural ODEモデルの両方を用いて、GANおよびNeural ODEファミリーのモデルの比較効率について検討した。
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